60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1546 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  743    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3585  protein of unknown function DUF917  68.61 
 
 		 365 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0864  protein of unknown function DUF917  60.93 
 
 		 366 aa  485  1e-136  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1964  hypothetical protein  66.29 
 
 		 367 aa  471  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1824  hypothetical protein  54.29 
 
 		 367 aa  420  1e-116  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3065  protein of unknown function DUF917  53.35 
 
 		 369 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0428  hypothetical protein  51.57 
 
 		 362 aa  367  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.232081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4109  protein of unknown function DUF917  52.08 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal  0.453442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1726  hypothetical protein  47.66 
 
 		 369 aa  359  5e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1994  protein of unknown function DUF917  46.56 
 
 		 369 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0651  protein of unknown function DUF917  52.08 
 
 		 367 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0286525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3365  hypothetical protein  52.26 
 
 		 355 aa  348  1e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.117929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1849  hypothetical protein  50.43 
 
 		 361 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0096  hypothetical protein  49.85 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0429  hypothetical protein  48.25 
 
 		 367 aa  310  4e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.329691  normal  0.645536 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5380  hypothetical protein  47.22 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22880  hypothetical protein  50.88 
 
 		 362 aa  295  7e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.602917 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4113  hypothetical protein  42.78 
 
 		 360 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22870  hypothetical protein  44.41 
 
 		 368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1850  hypothetical protein  39.83 
 
 		 372 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.683335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2451  protein of unknown function DUF917  41.14 
 
 		 360 aa  270  2e-71  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2140  protein of unknown function DUF917  44.73 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0447006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2950  hypothetical protein  39.66 
 
 		 356 aa  264  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.559043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5379  hypothetical protein  40.06 
 
 		 374 aa  259  8e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4195  hypothetical protein  37.11 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0569866  normal  0.0852747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2417  hypothetical protein  38.87 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2212  protein of unknown function DUF917  41.14 
 
 		 381 aa  243  5e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4117  protein of unknown function DUF917  40.86 
 
 		 375 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3582  protein of unknown function DUF917  36.07 
 
 		 371 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4084  hypothetical protein  35.85 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0395  hypothetical protein  34.24 
 
 		 369 aa  219  7e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3369  hypothetical protein  35.44 
 
 		 390 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000644747  normal  0.359309 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2453  protein of unknown function DUF917  34.05 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.465127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2213  protein of unknown function DUF917  31.79 
 
 		 357 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.800798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1543  hypothetical protein  31.97 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1967  hypothetical protein  31.77 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3468  hypothetical protein  31.42 
 
 		 373 aa  160  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1347  hypothetical protein  29.49 
 
 		 370 aa  159  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2201  protein of unknown function DUF917  29.75 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0430  hypothetical protein  30.2 
 
 		 354 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0098  hypothetical protein  30.62 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41374  predicted protein  29.27 
 
 		 983 aa  141  1.9999999999999998e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07952  conserved hypothetical protein  32.33 
 
 		 994 aa  139  8.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.77272  normal  0.240542 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04610  hydantoinase, putative  30.34 
 
 		 999 aa  136  7.000000000000001e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.6497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3647  hypothetical protein  26.46 
 
 		 360 aa  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4042  hypothetical protein  27.83 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  decreased coverage  0.00123714 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2687  protein of unknown function DUF917  26.69 
 
 		 354 aa  90.5  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0300826  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3015  hypothetical protein  29.31 
 
 		 363 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.621778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2260  hypothetical protein  25.3 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294656  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2548  hypothetical protein  27.54 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.836938  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0210  hypothetical protein  30.15 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2042  hypothetical protein  28.1 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5611  hypothetical protein  24.43 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2183  OsrF  28.1 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2075  protein of unknown function DUF917  25 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.416017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0137  hypothetical protein  24.49 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4633  protein of unknown function DUF917  26.47 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.951403  normal  0.119918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22860  hypothetical protein  24.84 
 
 		 344 aa  57  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.420757 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4362  protein of unknown function DUF917  25.29 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0183208 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2639  hypothetical protein  26.39 
 
 		 361 aa  52.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.195179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>