275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1255 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 
216 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.86 
 
 
169 aa  98.6  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.58 
 
 
221 aa  89  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.57 
 
 
216 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  31.82 
 
 
167 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  35.92 
 
 
164 aa  84  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  35 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  39.34 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0013  flavin reductase domain-containing protein  35.29 
 
 
166 aa  80.9  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.329029  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  29.08 
 
 
152 aa  81.3  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.51 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.81 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0643  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.08 
 
 
159 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0543494  normal  0.644181 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  32.39 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.76 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  36.76 
 
 
160 aa  75.9  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  33.33 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3170  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.38 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2008  hypothetical protein  37.04 
 
 
160 aa  71.6  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  29.45 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
149 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1228  flavin reductase domain-containing protein  32.82 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.11 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  26.99 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  32.43 
 
 
430 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  28.07 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1524  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.77 
 
 
215 aa  68.2  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  28 
 
 
229 aa  68.2  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  33.87 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  28.29 
 
 
166 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2978  flavin reductase-like, FMN-binding  27.86 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4081  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.12 
 
 
163 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395144  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1141  flavin reductase domain-containing protein  29.17 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.494396  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  28.24 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.03 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.57 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1034  flavin reductase domain-containing protein  29.06 
 
 
164 aa  65.1  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  28.48 
 
 
162 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  30.25 
 
 
178 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0083  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
205 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0343  flavin reductase-like, FMN-binding  30.4 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.37872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  28.57 
 
 
160 aa  62.4  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.21 
 
 
157 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  25.22 
 
 
318 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  30.77 
 
 
160 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0743  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.94 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2046  hypothetical protein  29.41 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.179971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4109  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.5 
 
 
174 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0327  hypothetical protein  32.48 
 
 
160 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217088  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0576  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.45 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10001  hypothetical protein  32.48 
 
 
160 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.537095  normal  0.391839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4076  flavin reductase domain-containing protein  26.21 
 
 
196 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.125733 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0917  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  decreased coverage  0.00504908  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14951  hypothetical protein  30.23 
 
 
168 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.431741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0853  flavin reductase domain-containing protein  27.73 
 
 
185 aa  59.7  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  25 
 
 
169 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6997  flavin reductase-like, FMN-binding protein  26.47 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1222  flavin reductase domain protein FMN-binding  25 
 
 
215 aa  58.9  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.996876  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09761  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.432138  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09781  hypothetical protein  32.48 
 
 
162 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  26.03 
 
 
172 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  26.15 
 
 
164 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  24.81 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1145  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  29.11 
 
 
197 aa  57.8  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2839  flavin reductase-like, FMN-binding  25.58 
 
 
202 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  24.31 
 
 
173 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  29.63 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4324  flavin reductase domain-containing protein  23.97 
 
 
327 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6116  flavin reductase domain-containing protein  26.96 
 
 
320 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.362693  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3970  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
193 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169391  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4083  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.77 
 
 
225 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.575581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7368  flavin reductase-like, FMN-binding  26.02 
 
 
169 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.44 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13600  oxidoreductase  32.04 
 
 
187 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.295254  normal  0.297766 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2697  flavin reductase domain-containing protein  25.83 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4078  flavin reductase domain-containing protein  25.47 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13022  oxidoreductase  24.62 
 
 
204 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.17 
 
 
159 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3349  flavoredoxin Flr  32.84 
 
 
188 aa  55.5  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0445888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  29.36 
 
 
160 aa  55.1  0.0000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5724  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.82 
 
 
179 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2225  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.56 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5305  flavin reductase domain-containing protein  30.1 
 
 
188 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.843488  normal  0.297216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.56 
 
 
155 aa  55.1  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  25.97 
 
 
167 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  27.21 
 
 
166 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  22.76 
 
 
189 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.25 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0666  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 
575 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1270  flavin reductase domain-containing protein  29.22 
 
 
181 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.285703  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0685  flavin reductase domain protein FMN-binding  28.47 
 
 
575 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0202  flavin reductase domain-containing protein  26.32 
 
 
176 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.635021  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7131  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.98 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2083  flavin reductase-like, FMN-binding  21.48 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  26.15 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.89 
 
 
171 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4765  flavin reductase-like, FMN-binding  27.01 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.119665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2549  flavin reductase domain-containing protein  31.06 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355058  normal  0.136226 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>