173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0083 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0083  flavin reductase domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  421  1e-117  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24760  conserved protein of DIM6/NTAB family  37.89 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1124  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.77 
 
 		 236 aa  167  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.373521  hitchhiker  0.0000000875399 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  36.68 
 
 		 229 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  34.55 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.84 
 
 		 221 aa  144  6e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.8 
 
 		 227 aa  144  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0873  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  39.05 
 
 		 169 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000143727  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0001  flavin reductase domain-containing protein  35.76 
 
 		 171 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1579  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.94 
 
 		 176 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0013  flavin reductase domain-containing protein  37.04 
 
 		 166 aa  105  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.329029  normal  0.100605 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.13 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0162  flavin reductase-like protein  26.21 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1253  flavin reductase-like, FMN-binding protein  23.61 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.516374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0769  flavin reductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2464  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.13 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0792  flavin reductase domain-containing protein  25.17 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1255  flavin reductase domain-containing protein  31.71 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0319  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.8 
 
 		 183 aa  62  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.42584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2124  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.52 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.159244  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5077  nitrilotriacetate monooxygenase  26.39 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1752  flavin reductase domain-containing protein  27.81 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.503981  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0349  flavin reductase domain-containing protein  26.81 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.66 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5343  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  30.3 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4751  flavin reductase domain-containing protein  27.07 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.527565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  23.68 
 
 		 169 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2731  flavin reductase-like domain-containing protein  27.03 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.066131  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  27.33 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  26.35 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  26.49 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1781  flavin reductase-like, FMN-binding protein  25.68 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.160868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  26.9 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1643  flavin reductase-like protein  27.73 
 
 		 170 aa  54.3  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1965  flavin reductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 167 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.106654  normal  0.180351 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4570  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.65 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.880752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0160  flavin reductase domain protein FMN-binding  27.45 
 
 		 159 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  23.94 
 
 		 162 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4363  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.68 
 
 		 174 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3603  putative oxygenase  28.48 
 
 		 172 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000048428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1909  flavin reductase domain protein FMN-binding  21.79 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0945  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.01 
 
 		 170 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.930099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08811  hypothetical protein  26.11 
 
 		 160 aa  52  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102678 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  22.52 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3504  flavin reductase domain-containing protein  27.16 
 
 		 309 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0504926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  26.28 
 
 		 172 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48766  predicted protein  26 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6121  flavin reductase domain-containing protein  26.15 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.272267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1694  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25.2 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0487183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2205  flavin reductase-like, FMN-binding  24.36 
 
 		 162 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.361259  normal  0.347764 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  46.67 
 
 		 696 aa  50.1  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1919  flavin reductase-like, FMN-binding  25.66 
 
 		 159 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2283  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.35 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5504  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.19 
 
 		 330 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.414218  decreased coverage  0.000482944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6349  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.81 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00500234  hitchhiker  0.000771796 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6253  flavin reductase domain-containing protein  27.34 
 
 		 311 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103541  normal  0.25638 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2888  flavin reductase domain-containing protein  25.41 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  26.21 
 
 		 156 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4939  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.92 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.372031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0388  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  18.95 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1364  hypothetical protein  25.32 
 
 		 160 aa  49.7  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.290853 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  24.64 
 
 		 157 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  42.86 
 
 		 696 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3429  flavin reductase domain-containing protein  26.4 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.316172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3055  flavin reductase domain-containing protein  22.88 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  22.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2406  flavin reductase-like  26.85 
 
 		 161 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.17627  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2004  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  26.05 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  0.396345 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2215  nitrilotriacetate monooxygenase  27.27 
 
 		 318 aa  49.3  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1536  flavin reductase-like, FMN-binding protein  23.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.543924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1858  GntR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 393 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1559  flavin reductase domain-containing protein  23.03 
 
 		 163 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3468  flavin reductase-like, FMN-binding  26.67 
 
 		 174 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.235276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0938  flavin reductase-like, FMN-binding  32.14 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.940093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2695  flavin reductase domain-containing protein  24.84 
 
 		 178 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.2164  normal  0.150119 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3504  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.84 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.507811  normal  0.0756522 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2602  flavin reductase domain protein FMN-binding  23.84 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3141  flavin reductase domain protein FMN-binding  25.17 
 
 		 165 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13022  oxidoreductase  25.81 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0382  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.2 
 
 		 160 aa  48.5  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.610168  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  25 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3647  oxidoreductase, putative  26.17 
 
 		 161 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0722443  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6310  flavin reductase-like, FMN-binding  26.35 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.81 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1371  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  25 
 
 		 169 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.361303  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0252  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  24.24 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5310  flavoprotein oxidoreductase  25 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00829883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1466  flavin reductase domain-containing protein  22.49 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5531  flavin reductase domain protein FMN-binding  26.32 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0259957  decreased coverage  0.00000136774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0994  flavin reductase domain-containing protein  28 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0553  flavin reductase domain-containing protein  26.98 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2289  flavin reductase domain-containing protein  22.54 
 
 		 323 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0610739 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  24.54 
 
 		 167 aa  47  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  24.67 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  24.67 
 
 		 172 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2672  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  26.52 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2523  flavin reductase-like, FMN-binding  27.78 
 
 		 346 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09651  hypothetical protein  28.37 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8271  flavin reductase domain-containing protein  24.65 
 
 		 168 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2478  flavin reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 302 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.375829  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>