More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1430 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  100 
 
 		 410 aa  808    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  37.6 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  37.08 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2988  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000335031  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  25.93 
 
 		 406 aa  145  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  27.49 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  28.14 
 
 		 395 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0296  arabinose efflux permease-like protein  27.71 
 
 		 411 aa  134  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000135127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1111  major facilitator transporter  31.18 
 
 		 384 aa  130  6e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0848  major facilitator transporter  27.93 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.589458  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 387 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1098  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 389 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 392 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  28.06 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0994  major facilitator superfamily MFS_1  40.24 
 
 		 424 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0227  major facilitator superfamily MFS_1  27.68 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142544  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  27.96 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3462  major facilitator transporter  25.47 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0107746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1354  multidrug-efflux transporter  27.08 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  25.62 
 
 		 381 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4096  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 416 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  28.23 
 
 		 409 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1215  major facilitator superfamily MFS_1  40.98 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 381 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  25.87 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  25.63 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 406 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4126  major facilitator superfamily MFS_1  26.46 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.641769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1111  major facilitator transporter  39.41 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  26.37 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  25.91 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  27.02 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4035  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 398 aa  97.1  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1063  major facilitator transporter  24.02 
 
 		 407 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  26.49 
 
 		 399 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  28.2 
 
 		 406 aa  95.5  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  38.82 
 
 		 424 aa  96.3  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  24.53 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1524  major facilitator superfamily MFS_1  33.68 
 
 		 425 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0937  major facilitator superfamily MFS_1  29.22 
 
 		 439 aa  94.4  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.725221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  25.58 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4478  major facilitator transporter  29.94 
 
 		 428 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000434229  decreased coverage  0.000716178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0137  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0342299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  29.38 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1956  major facilitator superfamily MFS_1  30.87 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3246  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3103  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 454 aa  91.3  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.973708  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3066  major facilitator transporter  26.9 
 
 		 456 aa  91.3  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  24.94 
 
 		 430 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 395 aa  90.5  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0552  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.929363 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  27.43 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  26.92 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  26.14 
 
 		 421 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1368  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.75 
 
 		 390 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0682  major facilitator superfamily MFS_1  29.2 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0710  major facilitator superfamily MFS_1  23.84 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  25.38 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  25.26 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  25.74 
 
 		 390 aa  87.8  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.75 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.28 
 
 		 407 aa  87.8  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0169  major facilitator superfamily permease  24.11 
 
 		 411 aa  87.4  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  24.8 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  24.8 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  30 
 
 		 416 aa  87  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4868  major facilitator transporter  25.68 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.174951 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0773  multidrug resistance protein, putative  27.57 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  25.47 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2425  major facilitator transporter  26.61 
 
 		 458 aa  86.7  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  22.47 
 
 		 400 aa  86.7  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  24.8 
 
 		 392 aa  86.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  25.2 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.14 
 
 		 395 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.2 
 
 		 384 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 426 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0424  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  22.47 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0436  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 403 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal  0.769414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.89 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  29.89 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0852  major facilitator transporter  24.35 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  23.13 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  22.73 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1085  major facilitator transporter  26.54 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.107795  hitchhiker  0.00000502867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0418  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 403 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  28.53 
 
 		 394 aa  84.3  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0725  drug resistance protein, putative  42.96 
 
 		 417 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  22.67 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>