More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2676 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0005  DNA gyrase subunit B  54.98 
 
 		 640 aa  676    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  53.08 
 
 		 640 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  636    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  54.95 
 
 		 635 aa  663    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  647    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  55.61 
 
 		 636 aa  642    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  53.87 
 
 		 640 aa  654    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  53.81 
 
 		 640 aa  662    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  51.17 
 
 		 647 aa  644    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  53.25 
 
 		 641 aa  650    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0005  DNA gyrase, B subunit  55.85 
 
 		 637 aa  672    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  54.85 
 
 		 633 aa  672    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  51.1 
 
 		 648 aa  643    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  54.49 
 
 		 635 aa  644    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  52.6 
 
 		 635 aa  635    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  647    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  53.43 
 
 		 650 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2676  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 638 aa  1308    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000429732  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  51.73 
 
 		 645 aa  637    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  56.78 
 
 		 634 aa  702    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  52.39 
 
 		 636 aa  635    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  53.71 
 
 		 640 aa  653    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  52.26 
 
 		 644 aa  643    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  52.37 
 
 		 644 aa  648    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  53.26 
 
 		 640 aa  675    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  55.34 
 
 		 632 aa  703    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  55.25 
 
 		 638 aa  677    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.96 
 
 		 654 aa  635    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  54.69 
 
 		 633 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  53.55 
 
 		 640 aa  648    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  52.87 
 
 		 642 aa  647    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  52.87 
 
 		 644 aa  669    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  636    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  51.75 
 
 		 633 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  51.32 
 
 		 649 aa  659    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  53.26 
 
 		 644 aa  656    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  52.68 
 
 		 649 aa  637    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0633  DNA topoisomerase IV subunit B  51.63 
 
 		 649 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.144503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  54.82 
 
 		 628 aa  688    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  647    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  55.77 
 
 		 644 aa  700    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  53.24 
 
 		 640 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  51.34 
 
 		 637 aa  636    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  52.05 
 
 		 644 aa  642    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1617  DNA topoisomerase IV subunit B  51.33 
 
 		 656 aa  637    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000200667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  52.92 
 
 		 640 aa  644    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  52.39 
 
 		 636 aa  634  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  51.8 
 
 		 654 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  54.21 
 
 		 638 aa  632  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  51.41 
 
 		 654 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 650 aa  632  1e-180  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  51.41 
 
 		 654 aa  632  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  52.57 
 
 		 643 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  51.67 
 
 		 636 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  53.04 
 
 		 650 aa  628  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1154  DNA topoisomerase IV subunit B  50.94 
 
 		 653 aa  630  1e-179  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  51.33 
 
 		 649 aa  629  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  52.07 
 
 		 642 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  54.21 
 
 		 638 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  52.42 
 
 		 651 aa  631  1e-179  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.72 
 
 		 654 aa  629  1e-179  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  51.48 
 
 		 643 aa  626  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  50 
 
 		 637 aa  625  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  50.16 
 
 		 637 aa  628  1e-178  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  48.67 
 
 		 648 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  49.92 
 
 		 645 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  51.59 
 
 		 640 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  50.23 
 
 		 638 aa  615  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  50.78 
 
 		 674 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  50.24 
 
 		 652 aa  617  1e-175  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  48.62 
 
 		 644 aa  612  9.999999999999999e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1416  DNA topoisomerase IV subunit B  50.39 
 
 		 665 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0092743  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  51.9 
 
 		 644 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  50.95 
 
 		 637 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1443  DNA topoisomerase IV subunit B  50.39 
 
 		 663 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0710964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  51.1 
 
 		 643 aa  609  1e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  49.07 
 
 		 651 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0925  DNA topoisomerase IV subunit B  49.61 
 
 		 666 aa  606  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.305492  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  50.55 
 
 		 655 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  49.77 
 
 		 645 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  48.38 
 
 		 643 aa  607  9.999999999999999e-173  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2326  DNA topoisomerase IV subunit B  48.2 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0942219  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2040  DNA topoisomerase IV subunit B  48.2 
 
 		 648 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  49.52 
 
 		 633 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00060  DNA gyrase subunit B  48.69 
 
 		 654 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0159442  normal  0.243862 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0296  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  48.15 
 
 		 642 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  49.92 
 
 		 651 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  48.92 
 
 		 641 aa  600  1e-170  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  49 
 
 		 646 aa  599  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  51.18 
 
 		 640 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0999  DNA topoisomerase IV subunit B  48.66 
 
 		 661 aa  601  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0005  DNA gyrase subunit B  50.24 
 
 		 672 aa  601  1e-170  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.78617  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  47.5 
 
 		 696 aa  600  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>