More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2388 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2388  aminotransferase class V  100 
 
 
541 aa  1114    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000269735  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2907  acetyltransferase, GNAT family  43.84 
 
 
527 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.397069 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2564  acetyltransferase, GNAT family  44.61 
 
 
527 aa  458  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.392411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2501  acetyltransferase  44.03 
 
 
527 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2275  aminotransferase class V  44.05 
 
 
527 aa  451  1e-125  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.484226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2217  serine-pyruvate aminotransferase  44.59 
 
 
527 aa  449  1e-125  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2423  acetyltransferase, GNAT family  42.75 
 
 
527 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2485  acetyltransferase, GNAT family  44.4 
 
 
527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2259  serine-pyruvate aminotransferase  44.4 
 
 
527 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000331198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2296  acetyltransferase  45.44 
 
 
527 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.071032  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2468  acetyltransferase  45.44 
 
 
527 aa  442  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.795198  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  29.28 
 
 
406 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  34.85 
 
 
386 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  32.89 
 
 
385 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.95 
 
 
360 aa  125  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  32.9 
 
 
382 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  32.9 
 
 
382 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  36.65 
 
 
382 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  36.9 
 
 
382 aa  123  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  31.6 
 
 
385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  35.86 
 
 
397 aa  120  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.75 
 
 
387 aa  119  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  31.53 
 
 
384 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  31.33 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.1 
 
 
387 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  32.45 
 
 
383 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  33.77 
 
 
384 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  33.72 
 
 
387 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  33.33 
 
 
387 aa  114  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  32.13 
 
 
382 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  26.92 
 
 
360 aa  114  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  31.1 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  29.23 
 
 
355 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  30.3 
 
 
385 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  28.96 
 
 
355 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  31.91 
 
 
363 aa  108  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0793  aminotransferase class V  28.12 
 
 
347 aa  106  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  31.56 
 
 
381 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  32.17 
 
 
384 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  32.17 
 
 
384 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  29.97 
 
 
356 aa  105  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16451  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  31.76 
 
 
394 aa  103  7e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.204159 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  33.07 
 
 
383 aa  103  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  29.24 
 
 
396 aa  102  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.03 
 
 
383 aa  103  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5058  alanine-glyoxylate aminotransferase  32.16 
 
 
381 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  32.45 
 
 
385 aa  102  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.1 
 
 
354 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  27.86 
 
 
368 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0491  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  30.24 
 
 
367 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2160  alanine-glyoxylate aminotransferase  30.09 
 
 
384 aa  100  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0644335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0478  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  29.43 
 
 
367 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168987  normal  0.470271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0533  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  29.43 
 
 
367 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3400  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  28.81 
 
 
354 aa  100  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0472  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  29.52 
 
 
367 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.456541  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  29.36 
 
 
355 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4014  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  28.65 
 
 
354 aa  99.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4850  Alanine--glyoxylate transaminase  26.53 
 
 
390 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.73 
 
 
355 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.73 
 
 
355 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.73 
 
 
355 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.45 
 
 
355 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0470  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  29.52 
 
 
367 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.45 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.73 
 
 
355 aa  99.4  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.65 
 
 
380 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  28.26 
 
 
354 aa  99  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  28.45 
 
 
355 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1916  aminotransferase, class V  31.6 
 
 
354 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  28.57 
 
 
383 aa  97.8  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  31.6 
 
 
355 aa  97.1  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  31.35 
 
 
358 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  26.76 
 
 
355 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  31.2 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  30.95 
 
 
358 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  25.14 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  31.2 
 
 
354 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0738  aminotransferase class V  29.95 
 
 
371 aa  95.1  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.873716  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  25.07 
 
 
357 aa  94.7  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  29.41 
 
 
388 aa  93.6  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0142  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  28.19 
 
 
412 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1862  aminotransferase class V  28.62 
 
 
401 aa  93.2  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  27.6 
 
 
384 aa  93.2  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07741  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.91 
 
 
412 aa  93.2  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.280804  normal  0.110591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0641  Alanine--glyoxylate transaminase  27.62 
 
 
370 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.322561  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  28 
 
 
385 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  31.48 
 
 
362 aa  92.4  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  27.24 
 
 
384 aa  92.4  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  28 
 
 
385 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1737  aminotransferase, class V  28.12 
 
 
339 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347432  hitchhiker  0.00095198 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  25.58 
 
 
386 aa  92.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  31.48 
 
 
362 aa  92  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  28.04 
 
 
358 aa  92  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  30.58 
 
 
382 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1674  aminotransferase, class V  31.23 
 
 
372 aa  91.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00211461  normal  0.187219 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1263  serine:pyruvate/alanine:glyoxylate aminotransferase  27.89 
 
 
394 aa  91.3  4e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  27.64 
 
 
363 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  26.47 
 
 
391 aa  90.9  5e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  30.24 
 
 
384 aa  91.3  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5094  aminotransferase class V  32.49 
 
 
381 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>