More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3533 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  94.63 
 
 
354 aa  681    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1916  aminotransferase, class V  95.2 
 
 
354 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3400  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  95.48 
 
 
354 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  95.76 
 
 
354 aa  687    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4014  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  98.59 
 
 
354 aa  708    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  100 
 
 
354 aa  719    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  95.76 
 
 
354 aa  687    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.2 
 
 
355 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.48 
 
 
355 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.2 
 
 
355 aa  618  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  87.04 
 
 
355 aa  618  1e-176  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.2 
 
 
355 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.2 
 
 
355 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.48 
 
 
355 aa  620  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  86.2 
 
 
355 aa  619  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  80.85 
 
 
363 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  78.87 
 
 
355 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  78.31 
 
 
355 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  76.06 
 
 
355 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  58.19 
 
 
356 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1052  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.4 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.26 
 
 
371 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3422  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  31.37 
 
 
370 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1440  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.1 
 
 
365 aa  203  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1218  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  203  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3966  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1240  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1341  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1415  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
365 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.806093 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1241  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.93 
 
 
365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1378  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.11 
 
 
365 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  35.03 
 
 
616 aa  200  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1481  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.1 
 
 
365 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000767  2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase  35.69 
 
 
367 aa  200  3e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.16 
 
 
400 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0546  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.84 
 
 
367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000447311  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  32.19 
 
 
406 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4874  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.54 
 
 
398 aa  189  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0491  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.44 
 
 
367 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0472  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.52 
 
 
367 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.456541  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0812  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.27 
 
 
376 aa  186  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0533  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.52 
 
 
367 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0478  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.52 
 
 
367 aa  185  9e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168987  normal  0.470271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0470  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.88 
 
 
367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  34.97 
 
 
368 aa  184  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2209  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.16 
 
 
368 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1834  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.16 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3683  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  33.52 
 
 
369 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3529  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  33.88 
 
 
368 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318249  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3461  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.97 
 
 
368 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.571414 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4081  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.22 
 
 
371 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0347  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.61 
 
 
369 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26402  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.19 
 
 
373 aa  176  6e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47300  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.22 
 
 
371 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2747  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.28 
 
 
368 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5190  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.72 
 
 
373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5064  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.97 
 
 
370 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.761871 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3422  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.64 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.157145  normal  0.100623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5871  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.6 
 
 
375 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2055  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  38.26 
 
 
369 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.669948  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4662  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.72 
 
 
369 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2116  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  33.33 
 
 
410 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1899  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0485  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0852  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195765  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1756  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.029748  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2210  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.97 
 
 
369 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102391  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0582  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.68 
 
 
369 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32 
 
 
383 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2142  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  32.49 
 
 
410 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4697  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  33.43 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3138  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  34.78 
 
 
376 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150503 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3066  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.75 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5301  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.75 
 
 
369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  31.3 
 
 
382 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.14 
 
 
376 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  30.99 
 
 
382 aa  160  3e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  35.21 
 
 
381 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3872  aminotransferase, class V  32.6 
 
 
371 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.31 
 
 
369 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  32.6 
 
 
374 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6497  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  33.33 
 
 
376 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453974  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  31.1 
 
 
382 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1165  aminotransferase, class V  28.73 
 
 
363 aa  158  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3718  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  32.5 
 
 
378 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  30.81 
 
 
382 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3162  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  32.84 
 
 
376 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  0.0318319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  30.55 
 
 
380 aa  153  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  29.44 
 
 
360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  31.21 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  30.95 
 
 
388 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3000  alanine--glyoxylate transaminase  30.88 
 
 
362 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  30.09 
 
 
384 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  30.37 
 
 
385 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  30.37 
 
 
382 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  31.03 
 
 
355 aa  143  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  30.37 
 
 
382 aa  143  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  28.86 
 
 
383 aa  142  7e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>