More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1165 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_1165  aminotransferase, class V  100 
 
 
363 aa  755    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3529  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.81 
 
 
368 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.318249  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2209  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.53 
 
 
368 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1834  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.18 
 
 
368 aa  293  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3461  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.9 
 
 
368 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.937677  normal  0.571414 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3683  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.97 
 
 
369 aa  290  3e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5190  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.3 
 
 
373 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.55 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00178187  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4662  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.02 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.743349  normal  0.408285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47300  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.39 
 
 
371 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0347  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.35 
 
 
369 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26402  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4081  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.11 
 
 
371 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3422  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  39.46 
 
 
370 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5871  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  43.02 
 
 
375 aa  279  5e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187739  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6497  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.83 
 
 
376 aa  279  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.453974  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5301  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.64 
 
 
369 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  normal  0.0407787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3066  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.64 
 
 
369 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779226  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4967  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.74 
 
 
369 aa  272  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0476873 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3138  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.55 
 
 
376 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000150503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3718  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  38.7 
 
 
378 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4874  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.5 
 
 
398 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428522  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3422  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.16 
 
 
369 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.157145  normal  0.100623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2116  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.11 
 
 
410 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  41.59 
 
 
376 aa  265  7e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.188417 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3162  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.78 
 
 
376 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.805462  normal  0.0318319 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2142  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.33 
 
 
410 aa  264  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0582  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.46 
 
 
369 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0852  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.102391  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2210  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1756  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  3e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.029748  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1899  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0485  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  42.18 
 
 
369 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5064  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.17 
 
 
370 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686649  normal  0.761871 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.25 
 
 
374 aa  259  4e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4697  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  39.22 
 
 
372 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.770845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0478  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.66 
 
 
367 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.168987  normal  0.470271 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0533  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.66 
 
 
367 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0472  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.66 
 
 
367 aa  256  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.456541  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2895  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  38.66 
 
 
371 aa  256  5e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.011056 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2055  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40 
 
 
369 aa  255  8e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.669948  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0470  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.38 
 
 
367 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0491  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  40.38 
 
 
367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0546  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.97 
 
 
367 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000447311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1440  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.57 
 
 
365 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1052  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.71 
 
 
365 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1241  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.71 
 
 
365 aa  236  3e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2747  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.19 
 
 
368 aa  236  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000767  2-aminoethylphosphonate:pyruvate aminotransferase  37.23 
 
 
367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04876  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  37.13 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1481  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.18 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2312  2-aminoethylphosphonate/pyruvate transaminase  35.73 
 
 
368 aa  233  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0812  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  36.54 
 
 
376 aa  234  3e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1240  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.29 
 
 
365 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1216  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.29 
 
 
365 aa  231  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1415  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.29 
 
 
365 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.806093 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1341  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.29 
 
 
365 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1218  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.01 
 
 
365 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3966  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.88 
 
 
365 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1378  2-aminoethylphosphonate--pyruvate transaminase  35.59 
 
 
365 aa  225  8e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7778  aminotransferase class V  32.6 
 
 
383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1315  aminotransferase, class V  31.01 
 
 
356 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.754091  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4473  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  30.62 
 
 
354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220366  normal  0.726481 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2233  putative aminotransferase class-V  29.69 
 
 
355 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3400  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  30.29 
 
 
354 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5997  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.69 
 
 
355 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.762607  normal  0.379829 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1415  nucleotidyl transferase/aminotransferase, class V  30.98 
 
 
616 aa  159  7e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3820  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.01 
 
 
363 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154189  normal  0.305313 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4119  aminotransferase, class V  30.29 
 
 
354 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142749  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4247  aminotransferase, class V  30.29 
 
 
354 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4014  2-aminoethylphosphonate aminotransferase  29.41 
 
 
354 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3533  aminotransferase, class V  28.73 
 
 
354 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1916  aminotransferase, class V  29.43 
 
 
354 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0778  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0689  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2028  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1770  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2063  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.302236  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0760  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1910  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.23 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1053  2-aminoethylphosphonate-pyruvate transaminase  29.51 
 
 
355 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1810  class V aminotransferase  30.2 
 
 
355 aa  150  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00984948  normal  0.0716447 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1817  putative aminotransferase  28.16 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2809  aminotransferase class V  26.1 
 
 
367 aa  122  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  28.02 
 
 
360 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  27.07 
 
 
384 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  27.58 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  27.95 
 
 
384 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  27.95 
 
 
384 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4878  aminotransferase, class V  25.31 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0765505  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2533  aminotransferase class V  26.23 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3872  aminotransferase, class V  26.71 
 
 
371 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  27.07 
 
 
383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  25.14 
 
 
388 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5312  Serine--pyruvate transaminase  24.03 
 
 
371 aa  109  8.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.295521 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1547  aminotransferase class V  26.23 
 
 
381 aa  109  8.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755241 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  26.01 
 
 
363 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1114  Serine--pyruvate transaminase  27.7 
 
 
384 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0516564  decreased coverage  0.00189491 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1887  Serine--pyruvate transaminase  28.26 
 
 
373 aa  105  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.195989  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0445  aminotransferase class-V  25.58 
 
 
369 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>