More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0442 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 		 429 aa  847    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  60.98 
 
 		 420 aa  520  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  59.02 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  59.81 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  59.58 
 
 		 421 aa  491  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  58.6 
 
 		 421 aa  486  1e-136  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  56.1 
 
 		 418 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  57.01 
 
 		 419 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  53.88 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  51.15 
 
 		 435 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  49.09 
 
 		 435 aa  436  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  48.64 
 
 		 435 aa  432  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  48.86 
 
 		 435 aa  431  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  50 
 
 		 430 aa  429  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  48.86 
 
 		 435 aa  428  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  55.16 
 
 		 419 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  49.89 
 
 		 429 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  48.39 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  48.86 
 
 		 435 aa  422  1e-117  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  49.77 
 
 		 445 aa  418  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  47.63 
 
 		 437 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  53.13 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  48.86 
 
 		 437 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  50.58 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  50.23 
 
 		 442 aa  410  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  50.35 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 		 435 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  50.12 
 
 		 447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  48.19 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2923  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.33 
 
 		 427 aa  392  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000208113  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  46.58 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  48.42 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  48.19 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  48.19 
 
 		 433 aa  393  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  49.54 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2135  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  49.31 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.233384  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  47.3 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1164  preprotein translocase, SecY subunit  48.13 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0798437  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  49.66 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  48.74 
 
 		 430 aa  383  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  46.73 
 
 		 437 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  48.97 
 
 		 423 aa  385  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  47.61 
 
 		 437 aa  382  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  46.3 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  47.27 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  46.79 
 
 		 434 aa  379  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  45.98 
 
 		 431 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.62 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2694  preprotein translocase subunit SecY  46.51 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2379  preprotein translocase subunit SecY  46.28 
 
 		 425 aa  380  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  47.14 
 
 		 434 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 		 434 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  46.22 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  47.96 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 		 443 aa  376  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  46.45 
 
 		 434 aa  375  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4256  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 		 443 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193642  unclonable  0.00000000000448849 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  49.09 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  45.39 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 		 434 aa  377  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  46.17 
 
 		 442 aa  373  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  47.61 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  47.59 
 
 		 446 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  47.52 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 		 443 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  45.5 
 
 		 442 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  47.06 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  45.26 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  45.02 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  44.79 
 
 		 444 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  44.79 
 
 		 444 aa  368  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  44.79 
 
 		 442 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  46.79 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  46.1 
 
 		 438 aa  372  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  46.34 
 
 		 443 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2754  preprotein translocase, SecY subunit  46.4 
 
 		 437 aa  370  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6029  preprotein translocase subunit SecY  46.15 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.175346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  46.79 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3647  preprotein translocase, SecY subunit  44.7 
 
 		 442 aa  368  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00118801  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 446 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.12 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  46.35 
 
 		 446 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  46.1 
 
 		 443 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1312  preprotein translocase subunit SecY  45.29 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000457849  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  47.4 
 
 		 441 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1118  preprotein translocase subunit SecY  44.72 
 
 		 428 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.348488  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  47.62 
 
 		 441 aa  365  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>