More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2863 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3051  Carbohydrate kinase, FGGY  64.8 
 
 
505 aa  646    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2863  carbohydrate kinase, FGGY  100 
 
 
505 aa  1002    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  55.6 
 
 
510 aa  537  1e-151  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3986  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  52.5 
 
 
501 aa  481  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.347065  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  51.1 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3125  carbohydrate kinase FGGY  50.5 
 
 
498 aa  433  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0202621  hitchhiker  0.00600222 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2114  carbohydrate kinase, FGGY  46.84 
 
 
495 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.700195 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29860  pentulose/hexulose kinase  48.5 
 
 
495 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32990  pentulose/hexulose kinase  47.5 
 
 
489 aa  424  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2566  carbohydrate kinase, FGGY  47.39 
 
 
493 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2529  carbohydrate kinase, FGGY  47.19 
 
 
493 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2574  carbohydrate kinase, FGGY  47.19 
 
 
493 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.281212  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  45.76 
 
 
506 aa  398  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3313  carbohydrate kinase, FGGY  43.09 
 
 
503 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0628  carbohydrate kinase, FGGY  33.14 
 
 
506 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0653  carbohydrate kinase FGGY  33.33 
 
 
506 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1609  xylulokinase  31.05 
 
 
506 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  31.75 
 
 
500 aa  264  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1150  Xylulokinase  30.69 
 
 
512 aa  260  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.569433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2025  xylulokinase  33.92 
 
 
509 aa  253  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0340  Xylulokinase  34.77 
 
 
508 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.769341  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0894  glycerol kinase  33.4 
 
 
538 aa  249  6e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  33.27 
 
 
501 aa  246  8e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09580  L-fuculokinase  29.51 
 
 
511 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  32.02 
 
 
518 aa  242  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4064  carbohydrate kinase FGGY  35.62 
 
 
548 aa  241  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.560605 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1988  carbohydrate kinase FGGY  27.97 
 
 
512 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  31.51 
 
 
509 aa  236  7e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2446  xylulokinase  34.32 
 
 
515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1267  carbohydrate kinase, FGGY  33.33 
 
 
501 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.93 
 
 
512 aa  232  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1006  carbohydrate kinase FGGY  29.47 
 
 
503 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00908398  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2620  xylulokinase  33.8 
 
 
506 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1510  carbohydrate kinase FGGY  33.14 
 
 
524 aa  227  4e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3774  carbohydrate kinase, FGGY  33.07 
 
 
493 aa  226  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.497194  normal  0.119028 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2391  carbohydrate kinase FGGY  30.22 
 
 
497 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  31.27 
 
 
496 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0402  xylulokinase  34.33 
 
 
498 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00337825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3232  Xylulokinase  31.21 
 
 
514 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.189507  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2886  xylulokinase  33.6 
 
 
504 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.13014  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3052  xylulokinase  33.27 
 
 
511 aa  216  9e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0504  xylulokinase  31.11 
 
 
514 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055116 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1912  carbohydrate kinase  33.72 
 
 
513 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.314119  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0861  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1194  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2073  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20388  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3419  xylulokinase  29.86 
 
 
488 aa  213  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000613693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1638  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241852  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4720  xylulokinase  33.59 
 
 
515 aa  213  7e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.552962 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0300  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104506  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1925  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
513 aa  213  7e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0220647  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3551  xylulokinase  33.14 
 
 
515 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4816  xylulokinase  33.14 
 
 
515 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.629474 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5467  xylulokinase  33.14 
 
 
515 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  0.140755 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0722  xylulokinase  29.84 
 
 
511 aa  211  3e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4197  xylulokinase  33.59 
 
 
515 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.88 
 
 
492 aa  210  4e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.88 
 
 
492 aa  210  4e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0888  xylulokinase  32.57 
 
 
515 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0535484  normal  0.805189 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1483  gluconate kinase  30.8 
 
 
514 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3431  xylulokinase  30.65 
 
 
509 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0224  xylulokinase  26.85 
 
 
490 aa  206  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2431  carbohydrate kinase  33.2 
 
 
514 aa  206  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2422  carbohydrate kinase, FGGY  31.91 
 
 
494 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2781  gluconate kinase  31.15 
 
 
530 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2467  carbohydrate kinase, FGGY  31.91 
 
 
494 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.634533  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0567  xylulokinase  28.51 
 
 
502 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.433437  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3787  xylulokinase  33.78 
 
 
520 aa  204  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0116938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2625  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 
505 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3685  carbohydrate kinase, FGGY  30.84 
 
 
510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2461  carbohydrate kinase, FGGY  31.52 
 
 
494 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1285  xylulokinase  31.16 
 
 
512 aa  200  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2211  xylulokinase  29.84 
 
 
500 aa  199  9e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12881  predicted protein  30.72 
 
 
438 aa  197  3e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3035  carbohydrate kinase FGGY  30.18 
 
 
502 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.976587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0537  carbohydrate kinase FGGY  29.48 
 
 
497 aa  195  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132305  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0476  carbohydrate kinase, FGGY  28.41 
 
 
499 aa  194  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2099  D-xylulose kinase  28.82 
 
 
496 aa  192  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4804  carbohydrate kinase FGGY  27.98 
 
 
486 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0809378  normal  0.0240502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1763  xylulokinase  31.24 
 
 
499 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3102  gluconate kinase  26.8 
 
 
512 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0131  xylulokinase  28.32 
 
 
503 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.435122  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1877  carbohydrate kinase, FGGY  33.27 
 
 
506 aa  188  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2770  xylulokinase  32.17 
 
 
511 aa  187  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1517  carbohydrate kinase  30.65 
 
 
517 aa  185  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.128905 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2691  carbohydrate kinase  31.23 
 
 
517 aa  184  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3895  carbohydrate kinase FGGY  31.64 
 
 
524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0417781  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  28.35 
 
 
499 aa  183  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0904  xylulokinase  31.11 
 
 
505 aa  183  7e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1663  gluconate kinase  27.2 
 
 
512 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0964235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2302  gluconate kinase  26.8 
 
 
512 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.028574  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1847  gluconate kinase  26.81 
 
 
512 aa  182  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1084  carbohydrate kinase, FGGY  25.88 
 
 
506 aa  182  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3177  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.946906  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3161  gluconate kinase (2-dehydro-3-deoxygluconokinase)  26.81 
 
 
513 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  31.93 
 
 
493 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3428  gluconate kinase  26.81 
 
 
513 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.708623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2093  gluconate kinase  27.8 
 
 
512 aa  182  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  32.67 
 
 
491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3038  xylulokinase  26.15 
 
 
489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.571184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>