More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0714 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  100 
 
 
211 aa  427  1e-119  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  64.45 
 
 
209 aa  278  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  49.18 
 
 
215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  48.63 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  41.58 
 
 
256 aa  157  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  43.66 
 
 
215 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  43.16 
 
 
224 aa  155  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  41.09 
 
 
223 aa  151  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  47.5 
 
 
210 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  41.04 
 
 
214 aa  150  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  45.98 
 
 
214 aa  148  7e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  37.02 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  54.55 
 
 
145 aa  146  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1256  signal-transduction protein  40 
 
 
210 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  43.07 
 
 
212 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  45.36 
 
 
212 aa  141  8e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2551  signal transduction protein  38.5 
 
 
220 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1585  CBS domain containing protein  37.56 
 
 
217 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  41.94 
 
 
219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  47.13 
 
 
216 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  38.5 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  47.13 
 
 
216 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  38.32 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0707  CBS domain containing membrane protein  37.99 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  45.52 
 
 
147 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  42.66 
 
 
149 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
232 aa  115  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  45.52 
 
 
147 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0714  CBS domain containing protein  39.1 
 
 
227 aa  115  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.724637  normal  0.522786 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  40.96 
 
 
216 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 
223 aa  112  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 
230 aa  111  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  33.95 
 
 
214 aa  111  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  33.49 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  36.93 
 
 
217 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2280  putative signal transduction protein with CBS domains  33.96 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2010  CBS domain-containing protein  39.53 
 
 
144 aa  105  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.348735  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1533  CBS domain containing membrane protein  31.22 
 
 
223 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.279871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 
225 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  42.31 
 
 
225 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 
144 aa  99.4  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  31.55 
 
 
225 aa  99.4  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0760  CBS domain containing protein  32.52 
 
 
217 aa  91.7  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2731  CBS domain containing membrane protein  28.09 
 
 
214 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.61 
 
 
262 aa  84  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  28.64 
 
 
202 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  26.76 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  26.76 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  25.35 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  25.35 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  29.72 
 
 
208 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  25.35 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3952  signal transduction protein  30.41 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  25.35 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  25.35 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4917  acetoin utilization protein AcuB  25.35 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  25.35 
 
 
214 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  24.88 
 
 
214 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
162 aa  79  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.28 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  24.88 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1304  signal-transduction protein  27.07 
 
 
200 aa  76.3  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2607  CBS domain containing membrane protein  39.86 
 
 
384 aa  75.9  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00560791  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  34.42 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  30.19 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  34.35 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  32.81 
 
 
845 aa  72.4  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  28.12 
 
 
873 aa  72.4  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  35.16 
 
 
149 aa  72  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0152  signal transduction protein  32.03 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0766  signal transduction protein  31.3 
 
 
269 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.024671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1759  CBS domain-containing protein  32 
 
 
258 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000639425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  35.66 
 
 
769 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2041  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000255814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2035  CBS domain-containing protein  32.03 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1776  CBS domain containing membrane protein  36.5 
 
 
381 aa  68.9  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17343  normal  0.316768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  31.93 
 
 
374 aa  68.9  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  28.26 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
279 aa  68.6  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2906  signal transduction protein  32.37 
 
 
291 aa  68.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  27.21 
 
 
426 aa  68.2  0.00000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  34.88 
 
 
378 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  32.86 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1740  signal transduction protein  31.62 
 
 
138 aa  67.4  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1425  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 
859 aa  68.2  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1907  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416143  hitchhiker  0.0000404489 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  31.88 
 
 
147 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  30.71 
 
 
883 aa  66.6  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  35.17 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  33.79 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  30.65 
 
 
488 aa  66.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  29.21 
 
 
482 aa  65.9  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  26.09 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.48 
 
 
487 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  32.88 
 
 
320 aa  65.9  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3228  XRE family transcriptional regulator  31.37 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1548  cyclic nucleotide-binding protein  33.06 
 
 
615 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  32.82 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0616  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
280 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000848956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>