More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4592 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4592  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
370 aa  764    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  32.93 
 
 
350 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  31.44 
 
 
350 aa  160  5e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003541  glycosyltransferase  29.3 
 
 
372 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0381  glycosyl transferase group 1  26.7 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 
384 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
367 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.18 
 
 
369 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.92 
 
 
369 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
369 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  24.02 
 
 
367 aa  110  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.74 
 
 
369 aa  109  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5545  glycosyltransferase  25.26 
 
 
371 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0040518  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  27.1 
 
 
370 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0204  glycosyl transferase group 1  25.4 
 
 
377 aa  108  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
386 aa  107  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
394 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  29.1 
 
 
371 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  29.17 
 
 
745 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
386 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3398  glycosyl transferase group 1  26.58 
 
 
382 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3264  glycosyl transferase group 1  26.06 
 
 
377 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4943  glycosyl transferase, putative  29.32 
 
 
376 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1793  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 
388 aa  103  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.488843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
376 aa  103  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  24.39 
 
 
371 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
385 aa  102  8e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5001  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.6 
 
 
365 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4815  glycosyl transferase, group 1  28.99 
 
 
376 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1939  glycosyl transferase, group 1  26.72 
 
 
384 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.324498  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4992  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
376 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
395 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 
394 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.27 
 
 
372 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0525  glycosyl transferase group 1  29 
 
 
376 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.566558  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2719  glycosyl transferase, group 1  26.91 
 
 
387 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541086  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  25.08 
 
 
370 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  23.47 
 
 
366 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 
380 aa  99.8  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.47 
 
 
366 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
394 aa  99.4  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0529  glycosyl transferase, group 1  28.52 
 
 
376 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.61936  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
362 aa  99  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.75 
 
 
745 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  25.51 
 
 
370 aa  99  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.65 
 
 
365 aa  97.8  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1755  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
365 aa  98.6  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2206  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 
371 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
401 aa  98.2  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  23.47 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  25.65 
 
 
403 aa  97.4  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0297  putative glycosyl transferase  25.37 
 
 
362 aa  97.8  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  28.78 
 
 
378 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 
398 aa  97.4  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  25.85 
 
 
385 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4421  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 
370 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 
393 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
357 aa  96.7  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.47 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  23.47 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 
409 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4009  glycosyl transferase, group 1  24.3 
 
 
365 aa  96.3  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
377 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.92 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3401  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
394 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  24.54 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  27.9 
 
 
398 aa  94.7  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3581  glycosyl transferase group 1  27.43 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  27.74 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1141  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.57 
 
 
397 aa  94.4  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  26.52 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  23.8 
 
 
389 aa  94  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 
382 aa  94  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0320  glycosyl transferase group 1  27.27 
 
 
373 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.527703  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0477  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
349 aa  93.6  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
409 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0668  glycosyl transferase, group 1  27.07 
 
 
378 aa  93.2  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000385091 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
381 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  30.45 
 
 
394 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  26.15 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0014  glycosyl transferase group 1  25.22 
 
 
335 aa  92.4  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  30.65 
 
 
394 aa  92.8  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  24.09 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4991  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.18 
 
 
376 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
411 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3711  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
376 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202497  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4439  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0593  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
369 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 
387 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.83 
 
 
390 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1355  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.64 
 
 
413 aa  89.7  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2727  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
401 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 
387 aa  89.7  8e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.2 
 
 
394 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>