162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2706 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2706  2OG-Fe(II) oxygenase  100 
 
 		 318 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1602  2OG-Fe(II) oxygenase  76.75 
 
 		 318 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.29559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0477  2OG-Fe(II) oxygenase  60.32 
 
 		 320 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.784236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1002  2OG-Fe(II) oxygenase  57.5 
 
 		 318 aa  375  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10948  oxidoreductase  54.72 
 
 		 316 aa  351  8e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.452034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2839  2OG-Fe(II) oxygenase  55.03 
 
 		 316 aa  347  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.323961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01276  oxidoreductase  46.98 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2834  2OG-Fe(II) oxygenase  46.54 
 
 		 311 aa  276  3e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.155948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1330  2OG-Fe(II) oxygenase  45.73 
 
 		 311 aa  267  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000246979  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1040  2OG-Fe(II) oxygenase  44.88 
 
 		 309 aa  263  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.93578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3772  2OG-Fe(II) oxygenase  45.14 
 
 		 348 aa  264  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17574  predicted protein  41.95 
 
 		 323 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.769732  normal  0.690692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1698  2OG-Fe(II) oxygenase  45.67 
 
 		 317 aa  255  5e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.199962  normal  0.108876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0182  2OG-Fe(II) oxygenase  46.84 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1098  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00260099  normal  0.465631 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03672  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 		 335 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.278231  normal  0.0460454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1716  2OG-Fe(II) oxygenase  33.76 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.863963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4357  2OG-Fe(II) oxygenase  32.39 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2035  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.415947  normal  0.577348 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1673  2OG-Fe(II) oxygenase  31.56 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120269  normal  0.0132289 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0856  2OG-Fe(II) oxygenase  33.56 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46878  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.75 
 
 		 321 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000173  isopenicillin N synthase  35.67 
 
 		 279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344159  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00051  conserved hypothetical protein: thymine dioxygenase (Eurofung)  31.8 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.862893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01711  Iron/ascorbate oxidoreductase  32.06 
 
 		 317 aa  153  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.745381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0225  putative oxidoreductase  30.7 
 
 		 320 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02720  conserved hypothetical protein  29.79 
 
 		 345 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  32.42 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07953  conserved hypothetical protein  32.02 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.679163  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01810  putative oxidoreductase  29.75 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.773533  normal  0.461944 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05807  isopenicillin N synthase  34.71 
 
 		 279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2994  2OG-Fe(II) oxygenase  29.34 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1982  2OG-Fe(II) oxygenase family oxidoreductase  34.41 
 
 		 280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0662  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.84 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.937654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2185  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2262  2OG-Fe(II) oxygenase  34.6 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1753  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2436  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.995426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1890  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0531  2OG-Fe(II) oxygenase  34.53 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1856  2OG-Fe(II) oxygenase  35.12 
 
 		 279 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.952041  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2435  2OG-Fe(II) oxygenase  30.35 
 
 		 318 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000377785  normal  0.0745566 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2589  iron/ascorbate family oxidoreductase  33.65 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2394  2OG-Fe(II) oxygenase  34.29 
 
 		 279 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0758  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  29.52 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1883  2OG-Fe(II) oxygenase  34.78 
 
 		 279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.251899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1487  2OG-Fe(II) oxygenase  33.44 
 
 		 279 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4351  2OG-Fe(II) oxygenase  28.53 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1362  2OG-Fe(II) oxygenase  32.85 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310836  normal  0.0218299 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1590  2OG-Fe(II) oxygenase  33.02 
 
 		 279 aa  138  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.253534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2507  2OG-Fe(II) oxygenase  33.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2030  2OG-Fe(II) oxygenase  34.65 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2305  2OG-Fe(II) oxygenase  34.08 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.622302  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1992  isopenicillin-N synthase  33.75 
 
 		 279 aa  136  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.254855  normal  0.142009 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2637  2OG-Fe(II) oxygenase  32.78 
 
 		 290 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00402461  normal  0.0478742 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0538  2OG-Fe(II) oxygenase  33.75 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1242  2OG-Fe(II) oxygenase  32.63 
 
 		 352 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.888679 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5574  2OG-Fe(II) oxygenase  30.53 
 
 		 321 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1053  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  32.17 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2219  2OG-Fe(II) oxygenase  31.9 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.127604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2858  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  28.97 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.863693  normal  0.0710897 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0871  2OG-Fe(II) oxygenase  34.02 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  decreased coverage  0.000000877808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11188  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00230)  30.45 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02390  conserved hypothetical protein  29.29 
 
 		 341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4741  putative 2OG-Fe(II) oxygenase  31.11 
 
 		 330 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00486881  normal  0.120796 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5408  flavonol synthase/dioxygenase  30.12 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.293243  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2980  oxidoreductase, 2OG-Fe(II) oxygenase family  28.66 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00391841  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05960  oxidoreductase, putative  31.45 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0672  2OG-Fe(II) oxygenase  31.85 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1135  2OG-Fe(II) oxygenase  31.01 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1818  putative oxidoreductase  30.58 
 
 		 329 aa  122  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0258  2OG-Fe(II) oxygenase  27.73 
 
 		 343 aa  122  6e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1380  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.9 
 
 		 353 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.87154  normal  0.0133355 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4252  2OG-Fe(II) oxygenase  29.01 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5111  2OG-Fe(II) oxygenase  29.66 
 
 		 335 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141171  normal  0.0243264 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2705  2OG-Fe(II) oxygenase  28.35 
 
 		 328 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.384991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4845  2OG-Fe(II) oxygenase  29.23 
 
 		 329 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.266793  normal  0.0471084 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0015  2OG-Fe(II) oxygenase  33.92 
 
 		 287 aa  117  3.9999999999999997e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00371983 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3789  2OG-Fe(II) oxygenase  28.82 
 
 		 352 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1140  2OG-Fe(II) oxygenase  29.19 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.592265  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3169  2OG-Fe(II) oxygenase  28.33 
 
 		 346 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000235169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1625  2OG-Fe(II) oxygenase  29.76 
 
 		 339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0261  2OG-Fe(II) oxygenase  29.71 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5231  2OG-Fe(II) oxygenase  27.97 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1085  2OG-Fe(II) oxygenase  31.33 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.758067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0316  2OG-Fe(II) oxygenase  30.25 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1850  2OG-Fe(II) oxygenase  30.36 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617074  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1897  2OG-Fe(II) oxygenase  30.36 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.995168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1831  2OG-Fe(II) oxygenase  30.36 
 
 		 346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1340  2OG-Fe(II) oxygenase  29.38 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0498174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2508  2OG-Fe(II) oxygenase family protein  29.39 
 
 		 347 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0728  2OG-Fe(II) oxygenase  29.89 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2602  2OG-Fe(II) oxygenase  30.24 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1265  2OG-Fe(II) oxygenase  25.98 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.602158  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0775  2OG-Fe(II) oxygenase  29.15 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214657  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7168  hypothetical protein  28.72 
 
 		 352 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.04303  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5009  2OG-Fe(II) oxygenase  29.77 
 
 		 330 aa  106  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.455169  normal  0.73905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2334  2OG-Fe(II) oxygenase  28.62 
 
 		 350 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31468  predicted protein  31.58 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.561665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4054  2OG-Fe(II) oxygenase  27.8 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.96316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>