More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0736 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0357  Phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.806672  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 226 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.32 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 240 aa  92.8  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 241 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.29 
 
 		 205 aa  92  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 256 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 237 aa  89.4  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.04 
 
 		 222 aa  88.6  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 207 aa  88.2  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 193 aa  87.8  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  35.93 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.34 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.42 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 196 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  31.76 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  31.74 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.53 
 
 		 443 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.85 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  35.25 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.21 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.94 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 223 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.93 
 
 		 207 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  23.76 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  23.76 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3483  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.75677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.22 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.22 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.48 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 		 200 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.14 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.81 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.39 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.81 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.73 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.58 
 
 		 444 aa  72.8  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>