More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4137 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4137  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
389 aa  725    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3939  major facilitator superfamily MFS_1  82.04 
 
 
408 aa  482  1e-135  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.798126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3219  major facilitator superfamily MFS_1  74.13 
 
 
396 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1108  major facilitator superfamily MFS_1  69.85 
 
 
396 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  59.42 
 
 
395 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  61.58 
 
 
405 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  60.94 
 
 
415 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  59.67 
 
 
397 aa  363  3e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0405  transporter  58.57 
 
 
403 aa  352  5e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.474552  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  57.02 
 
 
415 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1473  major facilitator transporter  55.1 
 
 
389 aa  323  4e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  48.03 
 
 
399 aa  277  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  49.58 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5265  major facilitator superfamily MFS_1  51.51 
 
 
394 aa  269  7e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1536  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
429 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1204  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
429 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0572721  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3082  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0490  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.252914  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0662  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.633492  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1404  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1408  major facilitator family transporter  52.38 
 
 
398 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.74121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2079  major facilitator transporter  48.4 
 
 
399 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.154057  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  52.68 
 
 
403 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5193  major facilitator superfamily MFS_1  50.42 
 
 
394 aa  263  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.380622 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  48.21 
 
 
404 aa  263  4e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4726  major facilitator transporter  50.14 
 
 
394 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.445553  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  39.35 
 
 
394 aa  259  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1477  major facilitator transporter  45.83 
 
 
391 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.14668  hitchhiker  0.0000166249 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7258  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 
407 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173664  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0748  major facilitator transporter  50.4 
 
 
399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.251921  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1229  major facilitator transporter  50.4 
 
 
399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.35258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1203  major facilitator transporter  50.67 
 
 
399 aa  250  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.446653  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4338  major facilitator transporter  49.87 
 
 
399 aa  250  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1111  major facilitator transporter  50.7 
 
 
399 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2837  major facilitator family transporter  50.41 
 
 
398 aa  242  9e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  43.72 
 
 
383 aa  242  1e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  41.64 
 
 
393 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1112  major facilitator transporter  50.42 
 
 
399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1598  major facilitator transporter  45.76 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.665811  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0153  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 
419 aa  233  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  42.7 
 
 
406 aa  231  1e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3482  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 
406 aa  231  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  41.27 
 
 
403 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0257  major facilitator superfamily MFS_1  44.08 
 
 
403 aa  230  3e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.209561  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2949  major facilitator transporter  46.65 
 
 
405 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137006  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4363  major facilitator transporter  46.37 
 
 
403 aa  228  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4774  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 
389 aa  228  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0185  major facilitator transporter  47.38 
 
 
410 aa  225  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151586 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  41.53 
 
 
390 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4800  major facilitator transporter  47.35 
 
 
412 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5392  major facilitator transporter  47.35 
 
 
412 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0287626  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5469  major facilitator transporter  47.35 
 
 
412 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414502  normal  0.121802 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  40.53 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  40.53 
 
 
405 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4478  major facilitator transporter  44.66 
 
 
407 aa  219  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.414241  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  40.53 
 
 
405 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  39.56 
 
 
405 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  42.32 
 
 
394 aa  216  4e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  39.26 
 
 
405 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  40.22 
 
 
398 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4811  major facilitator transporter  47.11 
 
 
410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.439865  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  39.3 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  40.53 
 
 
395 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  43.55 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  43.55 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  43.55 
 
 
394 aa  213  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5352  major facilitator transporter  47.08 
 
 
410 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660653  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  43.55 
 
 
394 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  37.84 
 
 
389 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  37.84 
 
 
389 aa  212  9e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3845  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
406 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0254807  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3959  major facilitator superfamily MFS_1  39.48 
 
 
406 aa  212  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.177015  normal  0.0110236 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.98 
 
 
399 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.98 
 
 
399 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.98 
 
 
399 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  43.22 
 
 
401 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1224  MFS permease  37.04 
 
 
415 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2964  major facilitator family transporter  43.28 
 
 
394 aa  210  3e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05543  hypothetical protein  41.67 
 
 
399 aa  209  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331898  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  41.29 
 
 
411 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0862  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
399 aa  208  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3317  major facilitator transporter  48.35 
 
 
411 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.209632 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  40.53 
 
 
398 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  41.99 
 
 
447 aa  206  7e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1561  major facilitator superfamily MFS_1  50.93 
 
 
420 aa  205  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224234  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3465  major facilitator superfamily MFS_1  36.05 
 
 
389 aa  204  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0698654 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2803  major facilitator family transporter  43.32 
 
 
394 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.0180883 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  38.13 
 
 
399 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  38.1 
 
 
426 aa  202  7e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1909  major facilitator superfamily MFS_1  38.44 
 
 
408 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.765785  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  37.88 
 
 
399 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  39.11 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 
387 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.9 
 
 
399 aa  200  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6889  major facilitator transporter  43.63 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.398856  normal  0.655887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2326  major facilitator transporter  39.11 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2143  major facilitator transporter  41.64 
 
 
402 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2929  major facilitator family transporter  41.36 
 
 
394 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3012  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00472083 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2995  major facilitator family transporter  42.2 
 
 
394 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00244716 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>