More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1818 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  100 
 
 
184 aa  374  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  65.76 
 
 
184 aa  246  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  65.22 
 
 
184 aa  244  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  65.19 
 
 
197 aa  240  9e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  64.25 
 
 
188 aa  239  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  64.25 
 
 
187 aa  239  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  64.25 
 
 
190 aa  238  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  65.19 
 
 
188 aa  237  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  59.56 
 
 
188 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  61.41 
 
 
189 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  60.22 
 
 
188 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  59.67 
 
 
188 aa  229  2e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  59.12 
 
 
185 aa  227  7e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  59.12 
 
 
185 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  59.67 
 
 
185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  59.67 
 
 
185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  58.47 
 
 
185 aa  224  5.0000000000000005e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  58.56 
 
 
185 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  57.61 
 
 
185 aa  219  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  59.12 
 
 
193 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  57.54 
 
 
193 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  52.22 
 
 
203 aa  185  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  53.71 
 
 
191 aa  184  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  53.71 
 
 
191 aa  184  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  52.51 
 
 
219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  50.28 
 
 
193 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  52.78 
 
 
199 aa  181  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 
201 aa  180  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  50.56 
 
 
187 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  52.27 
 
 
189 aa  178  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  51.4 
 
 
194 aa  177  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  52.84 
 
 
186 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  50.28 
 
 
228 aa  171  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  48.62 
 
 
192 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  50 
 
 
182 aa  169  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  48.88 
 
 
209 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  48.89 
 
 
191 aa  168  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  48.3 
 
 
201 aa  168  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  48.96 
 
 
206 aa  167  7e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  51.72 
 
 
218 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  46.99 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  47.22 
 
 
187 aa  164  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  47.85 
 
 
197 aa  164  9e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  51.14 
 
 
214 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  49.72 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  49.48 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  49.48 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  49.48 
 
 
204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  48.62 
 
 
197 aa  161  5.0000000000000005e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 
196 aa  161  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  48.33 
 
 
188 aa  160  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  51.96 
 
 
190 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  48.3 
 
 
189 aa  159  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
188 aa  159  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 
307 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  47.54 
 
 
307 aa  159  3e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3562  resolvase domain-containing protein  47.85 
 
 
208 aa  158  4e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  46.67 
 
 
194 aa  158  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  46.24 
 
 
190 aa  157  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  45.3 
 
 
184 aa  157  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  46.99 
 
 
198 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  47.59 
 
 
197 aa  155  3e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6782  resolvase domain-containing protein  52.2 
 
 
184 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.504828  normal 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  46.45 
 
 
194 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  46.99 
 
 
197 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  46.45 
 
 
194 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  46.99 
 
 
197 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  46.99 
 
 
197 aa  154  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  51.67 
 
 
189 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  48.96 
 
 
215 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  46.52 
 
 
201 aa  153  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  47.59 
 
 
224 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6785  resolvase domain-containing protein  52.81 
 
 
195 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  48.59 
 
 
196 aa  153  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  46.46 
 
 
204 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  46.52 
 
 
190 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  46.52 
 
 
190 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  46.52 
 
 
190 aa  152  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  43.33 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  43.33 
 
 
183 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  43.33 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  46.6 
 
 
210 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  53.96 
 
 
309 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  45.41 
 
 
189 aa  151  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 
193 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  45.05 
 
 
193 aa  151  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  48.62 
 
 
184 aa  150  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4105  resolvase domain-containing protein  53.1 
 
 
293 aa  150  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.571135  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3853  resolvase domain-containing protein  54.74 
 
 
326 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363521  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
193 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  52.84 
 
 
209 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4189  TonB-dependent receptor protein  55.47 
 
 
294 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_2482  TonB-dependent receptor protein  54.74 
 
 
294 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  49.69 
 
 
176 aa  147  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  43.92 
 
 
201 aa  147  6e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  45.11 
 
 
194 aa  147  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5093  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.993134 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  41.11 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>