More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2612 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2612  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 644 aa  1321    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.45331  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0740  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.98 
 
 		 645 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.641793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0961  Peptidoglycan glycosyltransferase  46.56 
 
 		 654 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171125 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1036  peptidoglycan glycosyltransferase  45.14 
 
 		 675 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0735  peptidoglycan glycosyltransferase  46.5 
 
 		 690 aa  559  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0180376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1107  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.06 
 
 		 710 aa  526  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3295  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 657 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0676  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 		 662 aa  409  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.832446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2208  peptidoglycan synthetase  37.95 
 
 		 656 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0406  penicillin-binding protein, transpeptidase  35.56 
 
 		 657 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3075  penicillin-binding protein  35.34 
 
 		 657 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.274173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0502  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 		 654 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.734645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0485  penicillin-binding protein transpeptidase  36.81 
 
 		 660 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3980  peptidoglycan glycosyltransferase  36.77 
 
 		 657 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2793  peptidoglycan glycosyltransferase  37.07 
 
 		 586 aa  351  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.121115  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3465  penicillin-binding protein, transpeptidase  36.91 
 
 		 703 aa  344  4e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00575858 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3598  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 587 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0348  peptidoglycan glycosyltransferase  34.64 
 
 		 578 aa  327  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.221621 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2850  penicillin-binding 3 precursor PBP-3 transmembrane protein  35.35 
 
 		 595 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3504  peptidoglycan synthetase FtsI  34.92 
 
 		 582 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.152932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3786  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 587 aa  325  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1570  stage V sporulation protein D  34.76 
 
 		 708 aa  324  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0457  peptidoglycan glycosyltransferase  36.92 
 
 		 615 aa  323  6e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0113  peptidoglycan synthetase FtsI  37.69 
 
 		 577 aa  323  8e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483173  normal  0.0772929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0089  peptidoglycan synthetase FtsI  35.27 
 
 		 588 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679095  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0131  peptidoglycan synthetase FtsI  34.78 
 
 		 588 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00085  transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis (penicillin-binding protein 3)  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3516  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0138  peptidoglycan synthetase FtsI  34.78 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.154008 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.78 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0077  peptidoglycan synthetase FtsI  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0090  peptidoglycan synthetase FtsI  35.08 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3573  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0010307 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0134  peptidoglycan synthetase FtsI  34.78 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000490417 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0092  peptidoglycan synthetase FtsI  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.948544 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0086  peptidoglycan synthetase FtsI  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.67693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00084  hypothetical protein  35.39 
 
 		 588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0139  peptidoglycan synthetase FtsI  34.78 
 
 		 588 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2924  penicillin-binding protein 3  36.6 
 
 		 587 aa  320  3e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3524  peptidoglycan glycosyltransferase  36.6 
 
 		 587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.568102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3393  penicillin-binding protein  36.6 
 
 		 587 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0759  peptidoglycan glycosyltransferase  34.15 
 
 		 631 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0071  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 615 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0553  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 615 aa  320  5e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0604  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.77 
 
 		 587 aa  320  7e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0524  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 615 aa  319  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2842  peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 616 aa  319  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0924392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3459  peptidoglycan glycosyltransferase  34.88 
 
 		 578 aa  318  3e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0440693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3639  peptidoglycan synthetase FtsI  36.54 
 
 		 615 aa  318  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.776215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1295  peptidoglycan synthetase FtsI  34.94 
 
 		 581 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1980  peptidoglycan synthetase FtsI  34.94 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0756202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0481  peptidoglycan glycosyltransferase  34.08 
 
 		 583 aa  317  4e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1976  peptidoglycan synthetase FtsI  34.94 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0049201  normal  0.138464 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2037  peptidoglycan synthetase FtsI  34.94 
 
 		 581 aa  317  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00133127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0482  peptidoglycan glycosyltransferase  36.35 
 
 		 615 aa  316  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1112  penicillin-binding protein  36.28 
 
 		 614 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0480  peptidoglycan synthetase FtsI  35.82 
 
 		 621 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.628858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3476  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.82 
 
 		 621 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000844175  normal  0.0161277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1479  peptidoglycan synthetase FtsI  34.76 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0193532  normal  0.796051 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3531  penicillin-binding protein  36.15 
 
 		 614 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0642  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.84 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.407482  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3525  peptidoglycan glycosyltransferase  34.81 
 
 		 586 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4539  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 		 578 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0157825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0755  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 		 587 aa  313  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0630  peptidoglycan synthetase FtsI  35.99 
 
 		 588 aa  313  7.999999999999999e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.624596  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2730  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 595 aa  313  7.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1337  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2557  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3556  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3226  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3551  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0478  penicillin-binding protein  35.96 
 
 		 614 aa  313  9e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.380913  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2679  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 624 aa  312  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3095  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4225  peptidoglycan synthetase FtsI  33.73 
 
 		 583 aa  310  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0396  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 584 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0407  peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 584 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830683 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0421  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.96 
 
 		 584 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0395  peptidoglycan glycosyltransferase  33.79 
 
 		 584 aa  310  5.9999999999999995e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0352  peptidoglycan synthetase FtsI  35.08 
 
 		 599 aa  310  6.999999999999999e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1590  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.81 
 
 		 692 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.150258  normal  0.450478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0913  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.32 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3576  peptidoglycan synthetase FtsI  33.39 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.027197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0380  peptidoglycan synthetase FtsI  33.39 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.359534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2986  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3749  peptidoglycan synthetase FtsI  33.39 
 
 		 583 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1069  peptidoglycan synthetase FtsI  34.25 
 
 		 577 aa  308  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00861821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3676  peptidoglycan synthetase FtsI  33.88 
 
 		 582 aa  308  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.383509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3433  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 588 aa  307  3e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.378657  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0562  peptidoglycan glycosyltransferase  31.92 
 
 		 577 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.445743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3817  peptidoglycan glycosyltransferase  34.51 
 
 		 578 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0404  peptidoglycan glycosyltransferase  33.8 
 
 		 578 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000306404 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3268  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.59 
 
 		 607 aa  306  8.000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0424379  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3431  peptidoglycan glycosyltransferase  33.82 
 
 		 580 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0456  peptidoglycan synthetase FtsI  34.69 
 
 		 607 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.619421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1004  peptidoglycan glycosyltransferase  36.21 
 
 		 638 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.855584  normal  0.147704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1141  peptidoglycan glycosyltransferase  33.21 
 
 		 610 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.062709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3423  peptidoglycan glycosyltransferase  34.25 
 
 		 578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.890377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0349  peptidoglycan glycosyltransferase  33.68 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1464  peptidoglycan glycosyltransferase  33.63 
 
 		 582 aa  303  9e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.923848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>