More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2041 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 435 aa  887    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  65.48 
 
 		 438 aa  578  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  58.69 
 
 		 437 aa  523  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  57.79 
 
 		 450 aa  510  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  55.27 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  59.02 
 
 		 441 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.97 
 
 		 739 aa  483  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  58.18 
 
 		 458 aa  471  1e-132  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  54.93 
 
 		 444 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  56.59 
 
 		 731 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  55.12 
 
 		 441 aa  455  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  56.45 
 
 		 735 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  54.44 
 
 		 441 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  55.47 
 
 		 435 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  57.55 
 
 		 459 aa  454  1.0000000000000001e-126  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.57 
 
 		 733 aa  451  1e-125  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.27 
 
 		 721 aa  450  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  54.7 
 
 		 422 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  52.78 
 
 		 432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.56 
 
 		 726 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  54.5 
 
 		 440 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  53.52 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  53.16 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  51.29 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.88 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  53.94 
 
 		 447 aa  435  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  53.16 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  53.05 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  53.06 
 
 		 734 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.57 
 
 		 734 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  53.77 
 
 		 448 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  50.73 
 
 		 455 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  54.91 
 
 		 436 aa  424  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  55.93 
 
 		 463 aa  423  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  51.99 
 
 		 440 aa  424  1e-117  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 432 aa  421  1e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  49.52 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.71 
 
 		 485 aa  415  9.999999999999999e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  52.75 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  48.94 
 
 		 457 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 457 aa  411  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  51.2 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  51.59 
 
 		 519 aa  413  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  53.32 
 
 		 494 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  54.72 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  54.01 
 
 		 448 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  51.16 
 
 		 443 aa  409  1e-113  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  52.12 
 
 		 505 aa  411  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 500 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4482  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.274389  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4294  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4131  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000013957  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4142  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 428 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391384  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  52.58 
 
 		 465 aa  405  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4628  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 428 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00879535  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4532  recombination factor protein RarA  50.37 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214289  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4479  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.56561e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  49.41 
 
 		 457 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0717  recombination factor protein RarA  49.63 
 
 		 428 aa  404  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000773245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  54.1 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  54.7 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  53.18 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  49.39 
 
 		 428 aa  403  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  52.08 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  47.82 
 
 		 416 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  52.67 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  52.67 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  50.7 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  48.21 
 
 		 463 aa  400  9.999999999999999e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  52.67 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  51.46 
 
 		 429 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  51.36 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  54.35 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00871  recombination factor protein RarA  46.48 
 
 		 428 aa  395  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 451 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  53.55 
 
 		 477 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  50.98 
 
 		 434 aa  393  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  53.4 
 
 		 456 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  51.4 
 
 		 435 aa  391  1e-107  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  52.91 
 
 		 452 aa  390  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  54.39 
 
 		 456 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15240  recombination factor protein RarA  55.47 
 
 		 457 aa  386  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.068247  normal  0.518579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 447 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01799  recombination factor protein RarA  48.79 
 
 		 451 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  48.55 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  46.75 
 
 		 453 aa  385  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  46.96 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00901  recombination factor protein RarA  44.6 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00891  recombination factor protein RarA  44.37 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  51.94 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2319  AAA ATPase central domain protein  51.24 
 
 		 460 aa  382  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1685  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000466548  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.71 
 
 		 437 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1718  recombination factor protein RarA  48.27 
 
 		 424 aa  378  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000735591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  46.6 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>