More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1129 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1129  inner-membrane translocator  100 
 
 		 299 aa  591  1e-168  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1722  inner-membrane translocator  65.77 
 
 		 300 aa  384  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1944  inner-membrane translocator  53.5 
 
 		 297 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3393  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  56.52 
 
 		 307 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2111  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  54.45 
 
 		 298 aa  301  9e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2271  inner-membrane translocator  53.66 
 
 		 297 aa  290  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.900398 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3055  inner-membrane translocator  49.09 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0934  inner-membrane translocator  42.53 
 
 		 327 aa  253  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000511533  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2238  inner-membrane translocator  48.11 
 
 		 326 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0535  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000217655 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2500  inner-membrane translocator  48.75 
 
 		 317 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.193513 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2016  inner-membrane translocator  44.04 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292526 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1480  inner-membrane translocator  47.58 
 
 		 407 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2554  inner-membrane translocator  45.85 
 
 		 322 aa  216  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1386  inner-membrane translocator  45.69 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0406  inner-membrane translocator  44.78 
 
 		 327 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0311713  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6000  branched-chain amino acid transport system permease protein  42.39 
 
 		 321 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108703  normal  0.0256137 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2395  inner-membrane translocator  44.29 
 
 		 407 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2609  inner-membrane translocator  42.86 
 
 		 415 aa  208  7e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4414  inner-membrane translocator  49.08 
 
 		 359 aa  208  9e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.743887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2365  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.21 
 
 		 339 aa  208  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.554509  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01987  amino-acid transmembrane ABC transporter protein  43.77 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.130303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0260  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  41.41 
 
 		 322 aa  206  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  43.49 
 
 		 562 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1580  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  42.81 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.571371  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3534  inner-membrane translocator  45.63 
 
 		 333 aa  204  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0462  inner-membrane translocator  43.53 
 
 		 331 aa  203  2e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2308  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 372 aa  202  5e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2500  inner-membrane translocator  48.45 
 
 		 407 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.62609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1471  inner-membrane translocator  38.91 
 
 		 376 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.959824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0267  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 357 aa  200  1.9999999999999998e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000311573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0637  inner-membrane translocator  40 
 
 		 347 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000477005  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1893  branched-chain amino acid ABC transporter permease  42.22 
 
 		 362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00991478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3206  inner-membrane translocator  42.14 
 
 		 318 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0836  inner-membrane translocator  40.5 
 
 		 318 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3103  inner-membrane translocator  39.74 
 
 		 340 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.60376 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1674  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 358 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1608  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0142848  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3772  inner-membrane translocator  38.41 
 
 		 372 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00496124  hitchhiker  0.00284039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0613  inner-membrane translocator  39 
 
 		 345 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0482  ABC transporter permease  41.07 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2958  ABC-type branched-chain amino acid transport system permease component-like protein  39.13 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4259  ABC branched-chain amino acid transporter, inner membrane subunit  45.74 
 
 		 352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2269  inner-membrane translocator  41.39 
 
 		 281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.458004  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0997  inner-membrane translocator  40.71 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.915307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2128  inner-membrane translocator  39.93 
 
 		 337 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4393  inner-membrane translocator  44.98 
 
 		 352 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1471  inner-membrane translocator  37.38 
 
 		 353 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0927911  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1837  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40 
 
 		 423 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.53398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1259  inner-membrane translocator  41.94 
 
 		 357 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19630  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.46 
 
 		 418 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000188502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4414  inner-membrane translocator  46.45 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2430  inner-membrane translocator  38.26 
 
 		 340 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.106551  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0333  inner-membrane translocator  41 
 
 		 281 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0354  inner-membrane translocator  42.96 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112024  normal  0.284931 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0567  inner-membrane translocator  38.59 
 
 		 443 aa  185  8e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.856247  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1395  inner-membrane translocator  40.89 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2977  inner-membrane translocator  37.2 
 
 		 454 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3908  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0554  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 433 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0237898  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0100  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  40.34 
 
 		 424 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3795  inner-membrane translocator  43.42 
 
 		 302 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.189427 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1673  inner-membrane translocator  39.86 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3840  inner-membrane translocator  37.83 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0125888  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3820  inner-membrane translocator  39.08 
 
 		 328 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0270491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4743  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 433 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127702  hitchhiker  0.000000177935 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5395  inner-membrane translocator  39.33 
 
 		 463 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.118271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1863  inner-membrane translocator  38.85 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4865  inner-membrane translocator  41.14 
 
 		 435 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.307682  hitchhiker  0.00000605126 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1067  inner-membrane translocator  37.99 
 
 		 346 aa  182  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0499919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1679  inner-membrane translocator  40 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2252  inner-membrane translocator  39.8 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2754  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  40.21 
 
 		 325 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129032  normal  0.265528 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0400  ABC transporter permease  38.11 
 
 		 316 aa  181  1e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1750  inner-membrane translocator  36.2 
 
 		 452 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40589  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3972  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.66 
 
 		 428 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.640531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0030  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 345 aa  180  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0774  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.54 
 
 		 427 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0264  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.3 
 
 		 389 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00136517  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2140  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.54 
 
 		 423 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0895739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4657  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.123215  decreased coverage  0.00142103 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0864  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.54 
 
 		 427 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0137433  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0065  inner-membrane translocator  38.31 
 
 		 282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.123483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4921  inner-membrane translocator  41.47 
 
 		 433 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0573712  decreased coverage  0.000000000000182248 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1885  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 389 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0590  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 389 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2496  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 389 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0246  leucine/isoleucine/valine transporter permease subunit  39.66 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2521  inner-membrane translocator  36.26 
 
 		 389 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0272  inner-membrane translocator  37.85 
 
 		 353 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.337151  normal  0.772291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1390  inner-membrane translocator  42.31 
 
 		 334 aa  179  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2543  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 389 aa  179  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.548123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2414  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 389 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0405273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5828  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.96 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.944679  normal  0.156755 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1427  inner-membrane translocator  40 
 
 		 286 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.732914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0798  inner-membrane translocator  37.62 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.640625 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0884  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00237971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1144  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  36.99 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0990  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0941  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.99 
 
 		 389 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0498835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>