More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0251 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  100 
 
 
128 aa  258  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  1.18892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 
129 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  78.91 
 
 
128 aa  201  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  73.6 
 
 
131 aa  199  1e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  72 
 
 
129 aa  197  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  194  2e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  70.31 
 
 
128 aa  195  2e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.06792e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  194  2e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  194  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 
131 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  9.18972e-09  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  191  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
129 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  191  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  191  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  76.15 
 
 
130 aa  191  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.94342e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  83.9 
 
 
130 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 
129 aa  190  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 
129 aa  190  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 
129 aa  189  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
131 aa  189  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  2.83991e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 
129 aa  189  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.97157e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
138 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 
130 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 
129 aa  187  3e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
129 aa  187  3e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  81.82 
 
 
134 aa  187  4e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  69.35 
 
 
130 aa  187  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 
129 aa  187  6e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 
130 aa  186  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  186  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  186  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  186  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 
131 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  185  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  185  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
129 aa  185  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  1.08519e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 
129 aa  184  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  183  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  183  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  74.6 
 
 
139 aa  183  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  2.71221e-05  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
130 aa  183  7e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 
130 aa  183  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  69.05 
 
 
129 aa  183  8e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
129 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
130 aa  183  9e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
129 aa  182  2e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  4.30937e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 
129 aa  182  2e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 
131 aa  181  2e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  4.56607e-06 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
130 aa  182  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 
129 aa  181  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 
131 aa  181  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 
138 aa  181  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  181  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  1.00663e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  74.8 
 
 
134 aa  180  4e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  73.6 
 
 
137 aa  180  6e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  75.38 
 
 
130 aa  179  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.00084e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  74.8 
 
 
134 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.20861e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
129 aa  178  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.58036e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  75.61 
 
 
133 aa  177  3e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.02059e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  8.03352e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.61096e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
129 aa  178  3e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
129 aa  178  3e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 
129 aa  177  3e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  7.00978e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.15107e-10  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 
137 aa  177  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  1.18735e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.39705e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 
131 aa  177  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  65.29 
 
 
183 aa  176  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  176  7e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  68.6 
 
 
131 aa  176  8e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  75.2 
 
 
132 aa  176  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.65846e-09  decreased coverage  4.90593e-09 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  76.52 
 
 
132 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.02694e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
135 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1135  ribosomal protein S11  75.4 
 
 
133 aa  176  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168888  normal  0.0833424 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  74.4 
 
 
132 aa  175  2e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  66.92 
 
 
130 aa  175  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  73.77 
 
 
135 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 
132 aa  174  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  70.83 
 
 
132 aa  174  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
130 aa  174  4e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  5.13052e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
135 aa  174  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
130 aa  174  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  6.07304e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  60.63 
 
 
130 aa  174  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  6.93018e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 
133 aa  173  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 
131 aa  173  6e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  4.03198e-11  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 
129 aa  173  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  68 
 
 
127 aa  173  6e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  76.52 
 
 
136 aa  173  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
137 aa  173  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>