More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1498 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  78.91 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  69.47 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  75.4 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  63.28 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 130 aa  179  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  72.36 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  178  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 134 aa  175  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  74.02 
 
 		 130 aa  173  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  75.44 
 
 		 132 aa  173  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  72.88 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60.48 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  58.91 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_002936  DET0500  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000251151  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_442  ribosomal protein S11  69.23 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000234354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  61.24 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  65.79 
 
 		 130 aa  169  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 129 aa  169  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 127 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  70.73 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  59.5 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  169  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  59.69 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  67.91 
 
 		 134 aa  167  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  60.98 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  64.06 
 
 		 128 aa  167  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>