More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3877 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  87.41 
 
 		 134 aa  220  6e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  86.67 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  86.67 
 
 		 135 aa  217  5e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  85.93 
 
 		 135 aa  217  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  85.19 
 
 		 135 aa  216  7e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  85.93 
 
 		 135 aa  215  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  80 
 
 		 135 aa  213  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  86.67 
 
 		 135 aa  212  9.999999999999999e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0653  ribosomal protein S11  82.22 
 
 		 135 aa  213  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  85.19 
 
 		 133 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29470  SSU ribosomal protein S11P  84.44 
 
 		 135 aa  208  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0093892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  82.35 
 
 		 136 aa  207  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  86.67 
 
 		 134 aa  207  3e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  81.02 
 
 		 137 aa  206  6e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  79.26 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  83.7 
 
 		 134 aa  203  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3114  ribosomal protein S11  82.96 
 
 		 135 aa  203  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  77.24 
 
 		 131 aa  202  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  81.48 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2627  30S ribosomal protein S11  82.96 
 
 		 133 aa  201  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  81.48 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0962  ribosomal protein S11  83.09 
 
 		 136 aa  200  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  86.89 
 
 		 135 aa  199  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  86.67 
 
 		 134 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16910  SSU ribosomal protein S11P  78.52 
 
 		 134 aa  197  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23540  SSU ribosomal protein S11P  80.74 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  84.92 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  83.7 
 
 		 135 aa  192  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 137 aa  192  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 136 aa  192  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  83.09 
 
 		 136 aa  191  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  80.65 
 
 		 138 aa  191  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  73.38 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  75.2 
 
 		 132 aa  187  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  76 
 
 		 132 aa  187  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  66.4 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 138 aa  180  8.000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  79.67 
 
 		 132 aa  179  8.000000000000001e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 		 129 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  78.05 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  71.76 
 
 		 139 aa  178  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1135  ribosomal protein S11  77.05 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168888  normal  0.0833424 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  176  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 129 aa  176  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 134 aa  176  9e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  68.61 
 
 		 137 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  68.97 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  72.36 
 
 		 128 aa  174  4e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  174  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  174  5e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  174  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.93 
 
 		 128 aa  174  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  58.52 
 
 		 135 aa  174  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  63.71 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  61.42 
 
 		 130 aa  173  7e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  60.61 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  63.2 
 
 		 133 aa  173  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  62.4 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  60.74 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  59.85 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>