More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1772 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  266  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 		 129 aa  236  5e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  231  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  230  6e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  227  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  227  5e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  226  6e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  226  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  223  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  223  8e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  222  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  221  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  219  8e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  217  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  216  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 130 aa  216  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 130 aa  214  4e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 		 130 aa  214  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  77.24 
 
 		 130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  209  9e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2456  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  206  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2178  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  206  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  71.09 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 129 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  201  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  199  8e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 128 aa  192  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0721  30S ribosomal protein S11  72.09 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 131 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 130 aa  187  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 135 aa  186  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  68.29 
 
 		 131 aa  186  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 		 133 aa  184  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  63.78 
 
 		 130 aa  184  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 130 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  71.76 
 
 		 131 aa  183  8e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  62.12 
 
 		 132 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 133 aa  181  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3925  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2511  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  64.75 
 
 		 183 aa  179  1e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>