More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0726 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  265  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  76.34 
 
 		 131 aa  214  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  71.76 
 
 		 129 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 131 aa  200  5e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  73.23 
 
 		 128 aa  200  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  79.13 
 
 		 130 aa  197  3e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 129 aa  196  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 129 aa  196  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 129 aa  196  6e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  78.26 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  80 
 
 		 131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  76.34 
 
 		 131 aa  193  6e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  190  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  78.69 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 130 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  185  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  68.7 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 130 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 132 aa  182  9e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 129 aa  180  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  75.78 
 
 		 134 aa  181  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 129 aa  180  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  61.65 
 
 		 133 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 		 131 aa  177  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  67.52 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 128 aa  176  8e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 130 aa  176  8e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 133 aa  176  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  65.81 
 
 		 133 aa  176  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  64.23 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  73.77 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  64.96 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  64.96 
 
 		 133 aa  175  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  72.13 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  78.26 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  78.26 
 
 		 131 aa  175  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  72.95 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0438  ribosomal protein S11  66.38 
 
 		 183 aa  174  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00108118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  71.88 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  68.97 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  64.57 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 134 aa  173  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0074  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 135 aa  173  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.475977  hitchhiker  0.00000000906112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  69.67 
 
 		 129 aa  172  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  76.27 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>