More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0312 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  260  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  209  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 128 aa  207  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  86.05 
 
 		 129 aa  202  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  70.54 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  72.87 
 
 		 128 aa  198  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  75.57 
 
 		 131 aa  197  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 		 129 aa  194  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  83.46 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  78.46 
 
 		 130 aa  194  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  194  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  81.6 
 
 		 138 aa  192  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.75 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  85.59 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  190  6e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 		 128 aa  189  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  84.3 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  72.44 
 
 		 131 aa  187  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  73.85 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  79.69 
 
 		 130 aa  184  4e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  183  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 130 aa  183  8e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  183  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  183  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2687  30S ribosomal protein S11  86.96 
 
 		 131 aa  182  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2372  30S ribosomal protein S11  86.96 
 
 		 131 aa  182  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  86.96 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 130 aa  181  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  74.8 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 137 aa  181  3e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  75.61 
 
 		 133 aa  180  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 131 aa  180  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>