More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0082 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
129 aa  262  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  250  5.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  250  6e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  250  6e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  6e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  250  6e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  93.02 
 
 
129 aa  249  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  248  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  247  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  247  3e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  91.47 
 
 
129 aa  247  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  91.47 
 
 
129 aa  247  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  91.47 
 
 
129 aa  247  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  92.25 
 
 
129 aa  247  3e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  89.92 
 
 
129 aa  244  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  89.92 
 
 
129 aa  241  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0351  30S ribosomal protein S11  88.37 
 
 
129 aa  239  7e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  227  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  83.85 
 
 
130 aa  226  9e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  83.85 
 
 
130 aa  226  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  224  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  82.31 
 
 
130 aa  224  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  82.31 
 
 
130 aa  223  7e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  80.77 
 
 
130 aa  223  8e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  80.77 
 
 
130 aa  223  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 
129 aa  222  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  80.77 
 
 
130 aa  222  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  221  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 
129 aa  219  8e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 
129 aa  219  8e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 
129 aa  219  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  79.84 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 
129 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
129 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3736  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000151104  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0254  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0219  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000388412  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0222  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000441654  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0222  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000236746  unclonable  0.0000000000190612 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0217  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000580806  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4033  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000372672  hitchhiker  0.0000000000775525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4147  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000204375  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0222  30S ribosomal protein S11  83.08 
 
 
130 aa  215  1e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251222  unclonable  0.0000000000422157 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  74.42 
 
 
129 aa  214  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3501  30S ribosomal protein S11  88.37 
 
 
129 aa  214  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000656378  hitchhiker  0.0000000781676 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  80.8 
 
 
128 aa  214  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2612  30S ribosomal protein S11  88.37 
 
 
129 aa  214  4e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.417638  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0742  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 
129 aa  212  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0701774  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  76.92 
 
 
130 aa  212  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2302  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 
127 aa  211  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.12621  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  76.38 
 
 
130 aa  211  2.9999999999999995e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0345  30S ribosomal protein S11  75.97 
 
 
129 aa  210  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000250973  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  73.64 
 
 
129 aa  209  9e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  86.61 
 
 
130 aa  208  3e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  73.28 
 
 
131 aa  205  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
132 aa  202  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 
133 aa  201  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 
135 aa  201  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0982  30S ribosomal protein S11  81.25 
 
 
131 aa  201  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000271815  hitchhiker  0.00410898 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 
133 aa  200  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  73.64 
 
 
129 aa  200  6e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 
134 aa  200  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 
134 aa  200  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 
134 aa  200  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2349  30S ribosomal protein S11  73.17 
 
 
128 aa  198  3e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
129 aa  197  5e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
129 aa  197  5e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  69.17 
 
 
133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.119474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>