More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2833 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  266  7e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  93.13 
 
 		 131 aa  234  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  80.92 
 
 		 131 aa  232  1.0000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  88.55 
 
 		 131 aa  226  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  88.7 
 
 		 130 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0958  30S ribosomal protein S11  88.55 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3303  30S ribosomal protein S11  88.55 
 
 		 131 aa  206  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332144 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  203  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  202  9e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  202  9e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  202  9e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  73.28 
 
 		 129 aa  202  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  72.52 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  79.31 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  72.52 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  71.65 
 
 		 128 aa  197  3.9999999999999996e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  76.34 
 
 		 131 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 130 aa  194  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 130 aa  194  5.000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  193  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  76.72 
 
 		 137 aa  193  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  70.63 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  70.63 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  70.63 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  192  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  75.4 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  75.86 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.18 
 
 		 131 aa  188  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 		 130 aa  187  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 139 aa  187  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  71.76 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 137 aa  183  7e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 137 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 136 aa  180  7e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 130 aa  179  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 131 aa  179  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3981  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 128 aa  179  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  68.97 
 
 		 132 aa  178  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  71.88 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 134 aa  177  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 139 aa  177  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  67.18 
 
 		 130 aa  176  8e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1741  30S ribosomal protein S11  72.52 
 
 		 129 aa  176  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.023772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2456  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2178  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  176  9e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 		 134 aa  176  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  70.99 
 
 		 127 aa  175  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 132 aa  176  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  70.87 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  62.5 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  175  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  72.52 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  174  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0721  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0103  30S ribosomal protein S11  71.76 
 
 		 129 aa  173  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.196275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 133 aa  174  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 130 aa  174  5e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>