More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0133 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  259  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  96.12 
 
 		 129 aa  229  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  221  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  221  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  221  4e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  216  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 		 129 aa  201  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  72.87 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  82.11 
 
 		 127 aa  197  3.9999999999999996e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  196  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  196  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0083  30S ribosomal protein S11  82.11 
 
 		 127 aa  193  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000400569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  193  7e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  193  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  72.44 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  75.97 
 
 		 128 aa  191  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  192  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  191  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  76.03 
 
 		 131 aa  191  4e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  85.25 
 
 		 134 aa  189  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  80.99 
 
 		 138 aa  189  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  189  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  80.99 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  68.22 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  67.44 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.85 
 
 		 131 aa  186  9e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  81.2 
 
 		 130 aa  185  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 130 aa  183  8e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  78.74 
 
 		 130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  78.91 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2376  30S ribosomal protein S11  78.86 
 
 		 127 aa  182  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00164353  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl149  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 		 130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  181  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0220  30S ribosomal protein S11  79.07 
 
 		 128 aa  180  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275034  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 135 aa  180  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 134 aa  180  7e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  85.22 
 
 		 134 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 131 aa  179  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  72.95 
 
 		 131 aa  178  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>