More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2372 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2687  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2372  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 		 129 aa  208  2e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  77.1 
 
 		 131 aa  203  5e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 130 aa  199  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  71.76 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 128 aa  197  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  84.43 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  82.11 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  69.05 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  78.86 
 
 		 129 aa  193  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  193  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  192  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  75.61 
 
 		 130 aa  192  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  82.2 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 130 aa  190  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  90.43 
 
 		 134 aa  190  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  78.63 
 
 		 129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  80.62 
 
 		 129 aa  187  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  75.2 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 137 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 131 aa  184  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  77.1 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  74.62 
 
 		 136 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  73.44 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  184  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  183  5e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  81.3 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 139 aa  183  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  76 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  76 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  76 
 
 		 138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  182  9e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  182  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  74.4 
 
 		 127 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 133 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 139 aa  181  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  68.99 
 
 		 130 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  72 
 
 		 135 aa  180  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>