More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4001 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  93.53 
 
 		 139 aa  245  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  92 
 
 		 137 aa  222  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  78.99 
 
 		 137 aa  214  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  78.26 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  71.2 
 
 		 131 aa  191  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  73.33 
 
 		 137 aa  190  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 		 129 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  84.21 
 
 		 134 aa  189  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 131 aa  188  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 		 129 aa  186  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  187  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 128 aa  186  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  73.68 
 
 		 136 aa  186  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  71.43 
 
 		 137 aa  184  3e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  73.88 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 134 aa  184  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  76.61 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  76.61 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  76.61 
 
 		 138 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  74.24 
 
 		 138 aa  183  6e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 		 129 aa  183  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 131 aa  183  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  183  7e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  65.87 
 
 		 129 aa  183  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  75.41 
 
 		 130 aa  183  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 		 131 aa  182  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  71.01 
 
 		 136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 128 aa  180  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 		 129 aa  180  7e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  179  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 130 aa  179  9.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 133 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  72.44 
 
 		 132 aa  178  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 131 aa  178  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  65.04 
 
 		 130 aa  177  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 127 aa  177  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  75.61 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  72.73 
 
 		 135 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  65.94 
 
 		 131 aa  176  8e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 135 aa  176  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  75.21 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  71.97 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 135 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  79.13 
 
 		 134 aa  175  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 130 aa  176  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 127 aa  176  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 127 aa  175  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  75.21 
 
 		 129 aa  174  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 135 aa  174  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 130 aa  174  4e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 132 aa  174  4e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  57.89 
 
 		 134 aa  174  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  73.98 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  63.2 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  68.1 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 129 aa  173  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0500  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000251151  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 134 aa  172  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>