More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1327 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  94.57 
 
 		 129 aa  254  4e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 		 129 aa  235  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  87.6 
 
 		 129 aa  233  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  86.82 
 
 		 129 aa  233  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  86.82 
 
 		 129 aa  233  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  93.8 
 
 		 129 aa  232  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  85.27 
 
 		 129 aa  231  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  228  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  227  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  226  9e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  224  2e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  223  6e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  83.72 
 
 		 129 aa  223  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  223  7e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  223  7e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  223  9e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  223  9e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  223  9e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  222  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  221  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  219  8e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  82.17 
 
 		 129 aa  219  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  85.37 
 
 		 130 aa  217  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  84.55 
 
 		 130 aa  216  6e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  78.29 
 
 		 129 aa  213  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  82.11 
 
 		 130 aa  212  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 		 130 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2178  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2456  30S ribosomal protein S11  84.5 
 
 		 129 aa  207  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  82.95 
 
 		 129 aa  206  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  85.34 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  76.74 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  81.4 
 
 		 129 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4775  30S ribosomal protein S11  85.27 
 
 		 129 aa  203  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103673 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0721  30S ribosomal protein S11  77.52 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.103667  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 131 aa  193  6e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  67.97 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3419  30S ribosomal protein S11  66.17 
 
 		 133 aa  186  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.119474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  76.52 
 
 		 131 aa  185  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 134 aa  185  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  64.18 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  64.93 
 
 		 134 aa  184  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 130 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  184  5e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 130 aa  183  8e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  74.78 
 
 		 131 aa  183  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  63.43 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 		 133 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2303  30S ribosomal protein S11  62.69 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  63.43 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  63.43 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  63.43 
 
 		 134 aa  180  8.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  65.04 
 
 		 131 aa  179  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  65.12 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  65.12 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  63.16 
 
 		 133 aa  177  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65.89 
 
 		 128 aa  177  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  64.34 
 
 		 129 aa  177  5.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>