More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1157 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  100 
 
 
130 aa  268  2e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.18 
 
 
131 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.35 
 
 
129 aa  183  5e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  65.35 
 
 
129 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  65.35 
 
 
129 aa  183  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 
130 aa  181  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 
130 aa  181  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  66.15 
 
 
128 aa  180  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  62.6 
 
 
129 aa  180  8.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
130 aa  179  1e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 
129 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 
129 aa  179  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
130 aa  178  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  72.36 
 
 
128 aa  178  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0342  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 
129 aa  179  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00110784  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  73.08 
 
 
129 aa  178  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  62.31 
 
 
130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 
130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 
129 aa  177  4e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  63.08 
 
 
129 aa  177  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  177  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  63.08 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  177  4.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
130 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03148  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.175069  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3683  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000095493  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0416  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00339967  unclonable  0.0000000142813 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03099  hypothetical protein  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.130382  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
130 aa  176  7e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3780  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000705759  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  176  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 
129 aa  176  8e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4296  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
130 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000132773  unclonable  0.0000000000385388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4521  30S ribosomal protein S11  61.79 
 
 
129 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000039204  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  70 
 
 
130 aa  175  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  66.92 
 
 
128 aa  175  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 
130 aa  174  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0082  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 
129 aa  174  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000625128  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
129 aa  174  4e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 
131 aa  174  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 
132 aa  174  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
129 aa  174  5e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0444  30S ribosomal protein S11  64.52 
 
 
128 aa  174  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.535193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 
133 aa  174  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
133 aa  173  6e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
135 aa  173  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  173  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
133 aa  173  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
133 aa  173  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
133 aa  173  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
129 aa  173  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2146  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 
129 aa  173  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.694866 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  63.36 
 
 
130 aa  173  7e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 
131 aa  173  8e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
134 aa  173  8e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
134 aa  173  8e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  58.06 
 
 
134 aa  173  8e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 
129 aa  173  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>