More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2930 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 134 aa  271  3e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  78.57 
 
 		 129 aa  211  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  78.57 
 
 		 129 aa  211  2.9999999999999995e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  78.57 
 
 		 129 aa  210  4.9999999999999996e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  87.4 
 
 		 130 aa  210  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  76.19 
 
 		 128 aa  202  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 		 130 aa  199  8e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  89.55 
 
 		 134 aa  199  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  87.7 
 
 		 129 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  77.69 
 
 		 131 aa  199  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  76.19 
 
 		 131 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 129 aa  197  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  71.65 
 
 		 129 aa  197  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  196  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  82.79 
 
 		 129 aa  196  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  81.82 
 
 		 128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  69.84 
 
 		 131 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  85.25 
 
 		 129 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 129 aa  194  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  84.3 
 
 		 129 aa  194  4.0000000000000005e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 129 aa  193  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  192  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  75.78 
 
 		 131 aa  191  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  84.75 
 
 		 130 aa  191  3e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  84.3 
 
 		 129 aa  191  4e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  76.98 
 
 		 129 aa  190  5e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  71.07 
 
 		 129 aa  188  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  187  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  73.91 
 
 		 130 aa  186  5.999999999999999e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 130 aa  187  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 		 131 aa  186  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 130 aa  186  9e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  83.61 
 
 		 129 aa  186  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  72.17 
 
 		 131 aa  185  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  69.29 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 		 138 aa  185  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 130 aa  186  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 128 aa  185  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  83.47 
 
 		 129 aa  185  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  79.51 
 
 		 127 aa  185  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 		 130 aa  184  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 		 129 aa  184  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  73.64 
 
 		 139 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  71.55 
 
 		 137 aa  183  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01430  ribosomal protein S11  78.26 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000902694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2687  30S ribosomal protein S11  84.35 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2372  30S ribosomal protein S11  84.35 
 
 		 131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.119572  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  71.97 
 
 		 134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  75.21 
 
 		 134 aa  181  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0083  30S ribosomal protein S11  80.33 
 
 		 127 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000400569  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0616  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  69.12 
 
 		 136 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  72.22 
 
 		 138 aa  181  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 		 137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  76.03 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 		 129 aa  180  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 		 137 aa  180  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  65.57 
 
 		 127 aa  179  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 130 aa  180  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  64.75 
 
 		 127 aa  179  1e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  69.83 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  74.6 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 		 130 aa  178  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 		 129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  68.94 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  69.77 
 
 		 137 aa  177  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  72.87 
 
 		 135 aa  177  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  80.17 
 
 		 132 aa  177  4.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  63.93 
 
 		 127 aa  176  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  64 
 
 		 131 aa  176  9e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  80.17 
 
 		 132 aa  176  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>