More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0893 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  74.22 
 
 
129 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  74.22 
 
 
129 aa  202  1e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  73.44 
 
 
129 aa  201  2e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  87.4 
 
 
134 aa  200  5e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  80 
 
 
130 aa  198  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  71.54 
 
 
128 aa  196  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  74.8 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  68.99 
 
 
131 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  69.23 
 
 
129 aa  193  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  80.99 
 
 
138 aa  192  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 
129 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  67.69 
 
 
129 aa  192  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  76.15 
 
 
128 aa  191  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  73.28 
 
 
131 aa  191  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  68.46 
 
 
129 aa  191  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  78.46 
 
 
129 aa  190  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 
129 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
131 aa  189  8e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  78.69 
 
 
139 aa  189  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
131 aa  188  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2433  30S ribosomal protein S11  83.47 
 
 
130 aa  188  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  79.23 
 
 
130 aa  188  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  81.82 
 
 
129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 
131 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  74.14 
 
 
137 aa  187  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  187  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 
131 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 
130 aa  186  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  186  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
129 aa  186  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  72.41 
 
 
132 aa  186  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
130 aa  186  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  186  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0726  30S ribosomal protein S11  74.05 
 
 
131 aa  185  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.873114  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  184  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  78.51 
 
 
134 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0785  30S ribosomal protein S11  86.96 
 
 
134 aa  184  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  68.6 
 
 
130 aa  184  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  69.23 
 
 
130 aa  184  3e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  66.92 
 
 
129 aa  184  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  73.6 
 
 
138 aa  184  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
130 aa  184  5e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  183  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  183  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1458  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 
129 aa  183  6e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000430937  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  78.46 
 
 
129 aa  183  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
134 aa  183  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  183  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  76.15 
 
 
129 aa  183  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  183  8e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  183  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  182  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  72.8 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  71.54 
 
 
128 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  76.8 
 
 
137 aa  182  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  76.86 
 
 
133 aa  181  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  74.4 
 
 
135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  73.28 
 
 
131 aa  181  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  67.77 
 
 
129 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 
130 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
137 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 
130 aa  180  6e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0236  30S ribosomal protein S11  65.38 
 
 
130 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000127993  unclonable  0.00000919144 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
138 aa  179  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
138 aa  179  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
138 aa  179  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
135 aa  178  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 
129 aa  179  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0193  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 
130 aa  178  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000310597  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0315  30S ribosomal protein S11  76.8 
 
 
129 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50356e-25 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0157  30S ribosomal protein S11  79.34 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000139705  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0181  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 
130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000807145  hitchhiker  0.00156032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5169  30S ribosomal protein S11  79.34 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  66.15 
 
 
129 aa  177  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0136  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000700978  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0136  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000120861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0131  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000558036  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0129  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000161096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  65.29 
 
 
132 aa  177  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0136  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000602059  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0149  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.28722e-60 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 
129 aa  177  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0171  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 
130 aa  177  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000137898  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1882  30S ribosomal protein S11  75.21 
 
 
127 aa  177  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0167  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000803352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4667  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000031185  unclonable  0.00000000812252 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0207  30S ribosomal protein S11  63.08 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000194302  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0130  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
129 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000100663  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  76.03 
 
 
135 aa  177  5.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 
133 aa  176  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>