More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1006 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 131 aa  264  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 130 aa  185  1e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  67.42 
 
 		 131 aa  184  4e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  74.02 
 
 		 128 aa  179  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  73.28 
 
 		 130 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  179  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 129 aa  178  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  177  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 129 aa  176  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  175  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  69.47 
 
 		 130 aa  174  3e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 		 131 aa  174  4e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 		 130 aa  172  9.999999999999999e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  71.65 
 
 		 132 aa  172  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  61.36 
 
 		 131 aa  172  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  66.12 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  68.46 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  61.72 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  69.29 
 
 		 138 aa  170  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  68.38 
 
 		 135 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  68.5 
 
 		 128 aa  168  2e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0512  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.11652  hitchhiker  0.00952872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0507  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 		 129 aa  168  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00376989  normal  0.069652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  68.12 
 
 		 137 aa  168  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 		 131 aa  167  4e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0354  30S ribosomal protein S11  68.7 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  67.86 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  63.49 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  70 
 
 		 136 aa  167  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1977  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  58.02 
 
 		 130 aa  167  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0317  30S ribosomal protein S11  59.38 
 
 		 129 aa  166  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.219979  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 		 130 aa  166  9e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 138 aa  165  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  71.9 
 
 		 134 aa  166  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 		 137 aa  166  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 138 aa  165  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 		 130 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  59.68 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  63.64 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 		 138 aa  165  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  66.67 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  68.25 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0481  30S ribosomal protein S11  59.54 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  67.77 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  65.15 
 
 		 131 aa  165  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  62.4 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  70.23 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  57.81 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  70.77 
 
 		 137 aa  164  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  62.81 
 
 		 129 aa  164  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  58.87 
 
 		 135 aa  164  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0416  ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000707305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3592  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00516698  normal  0.0514386 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3728  30S ribosomal protein S11  61.29 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00156058  hitchhiker  0.00442603 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 130 aa  163  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3491  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000857326  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4619  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  60.16 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  62.1 
 
 		 129 aa  163  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>