More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0714 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0714  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
131 aa  266  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000403198  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2582  30S ribosomal protein S11  99.24 
 
 
131 aa  265  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.16945  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  88.64 
 
 
132 aa  218  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2989  30S ribosomal protein S11  91.6 
 
 
131 aa  211  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.542716  normal  0.258691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2210  30S ribosomal protein S11  87.02 
 
 
130 aa  208  2e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3726  30S ribosomal protein S11  88.55 
 
 
130 aa  203  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0229  30S ribosomal protein S11  89.31 
 
 
130 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0226  30S ribosomal protein S11  89.31 
 
 
130 aa  197  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000119719  normal  0.0238771 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16561  30S ribosomal protein S11  81.1 
 
 
130 aa  197  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.750995  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17441  30S ribosomal protein S11  83.2 
 
 
130 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.809321  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17281  30S ribosomal protein S11  83.2 
 
 
130 aa  195  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1629  30S ribosomal protein S11  82.4 
 
 
130 aa  195  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0354  30S ribosomal protein S11  82.54 
 
 
130 aa  194  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.837845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1977  30S ribosomal protein S11  80 
 
 
130 aa  189  1e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333335  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  62.6 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  67.83 
 
 
131 aa  179  8.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23251  30S ribosomal protein S11  81.9 
 
 
130 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  66.96 
 
 
131 aa  178  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
138 aa  178  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1107  30S ribosomal protein S11  81.9 
 
 
130 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17181  30S ribosomal protein S11  79.53 
 
 
130 aa  177  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.962547  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19821  30S ribosomal protein S11  81.9 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.427205  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  65 
 
 
128 aa  177  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  67.24 
 
 
137 aa  176  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 
131 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  68 
 
 
139 aa  174  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  64.89 
 
 
128 aa  173  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  58.78 
 
 
129 aa  173  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  65.22 
 
 
130 aa  173  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.02 
 
 
129 aa  172  9e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  173  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  58.78 
 
 
129 aa  173  9e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 
131 aa  172  9e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1719  30S ribosomal protein S11  67.94 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000100084  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  59.54 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  58.59 
 
 
131 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  66.41 
 
 
130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  61.83 
 
 
131 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 
130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  67.2 
 
 
137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  65.38 
 
 
134 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  60 
 
 
129 aa  170  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  168  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  168  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  57.25 
 
 
129 aa  168  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  63.79 
 
 
129 aa  168  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  64.89 
 
 
130 aa  169  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  56.49 
 
 
129 aa  167  3e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3156  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
132 aa  167  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.980301  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  58.02 
 
 
131 aa  168  3e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 
127 aa  168  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  56.49 
 
 
129 aa  167  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  59.35 
 
 
127 aa  167  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  60.83 
 
 
130 aa  167  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0498  ribosomal protein S11  61.29 
 
 
126 aa  167  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.423848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3273  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 
133 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 
127 aa  167  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  71.3 
 
 
136 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2926  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 
133 aa  167  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000215404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3293  30S ribosomal protein S11  55.64 
 
 
133 aa  166  8e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  68.33 
 
 
134 aa  166  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  55.73 
 
 
129 aa  166  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2041  30S ribosomal protein S11  61.83 
 
 
131 aa  166  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00199904  hitchhiker  0.00122216 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  63.77 
 
 
138 aa  165  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2995  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.400424 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  56.82 
 
 
130 aa  165  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
133 aa  165  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2751  ribosomal protein S11  65 
 
 
129 aa  165  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0477  30S ribosomal protein S11  64.29 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000422996  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  62.83 
 
 
127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  57.5 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  59.17 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 
135 aa  164  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 
129 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  61.07 
 
 
129 aa  164  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  53.33 
 
 
135 aa  164  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  61.21 
 
 
129 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  56.67 
 
 
129 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>