More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01430 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01430  SSU ribosomal protein S11P  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.42719  normal  0.725515 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  88.37 
 
 
131 aa  240  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2806  ribosomal protein S11  94.7 
 
 
132 aa  226  6e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000365846  decreased coverage  0.00000000490593 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1135  ribosomal protein S11  85.61 
 
 
133 aa  208  2e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168888  normal  0.0833424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  82.11 
 
 
133 aa  193  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  80.49 
 
 
134 aa  192  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  78.63 
 
 
137 aa  190  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  70.16 
 
 
129 aa  190  7e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 
129 aa  190  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  78.63 
 
 
136 aa  190  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
134 aa  189  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  69.35 
 
 
129 aa  189  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
135 aa  189  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  67.42 
 
 
129 aa  188  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  68.94 
 
 
129 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  188  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  80.33 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  68.18 
 
 
129 aa  186  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
138 aa  186  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  68.18 
 
 
129 aa  186  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 
129 aa  184  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  183  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  78.51 
 
 
135 aa  183  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 
129 aa  183  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 
129 aa  183  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  78.86 
 
 
135 aa  183  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  74.4 
 
 
128 aa  183  7e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2619  30S ribosomal protein S11  80.49 
 
 
134 aa  183  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  183  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 
139 aa  182  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  78.86 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  79.34 
 
 
137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  78.05 
 
 
135 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  67.74 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  65.62 
 
 
130 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  76.52 
 
 
132 aa  182  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  79.67 
 
 
134 aa  181  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16910  SSU ribosomal protein S11P  80.99 
 
 
134 aa  181  3e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2941  30S ribosomal protein S11  81.82 
 
 
133 aa  181  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113794  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  78.05 
 
 
135 aa  181  3e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  67.2 
 
 
129 aa  181  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0612  ribosomal protein S11  78.51 
 
 
135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  66.94 
 
 
129 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0962  ribosomal protein S11  78.86 
 
 
136 aa  180  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.837228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  66.13 
 
 
129 aa  180  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  82.61 
 
 
134 aa  180  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  67.48 
 
 
129 aa  179  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  74.02 
 
 
130 aa  179  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  71.97 
 
 
132 aa  179  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68 
 
 
128 aa  179  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 
129 aa  179  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0591  30S ribosomal protein S11  81.74 
 
 
136 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.648378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6585  30S ribosomal protein S11  84.35 
 
 
135 aa  179  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 
129 aa  179  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  77.24 
 
 
136 aa  178  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  71.21 
 
 
132 aa  179  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2656  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 
133 aa  178  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23540  SSU ribosomal protein S11P  80.17 
 
 
134 aa  177  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  78.05 
 
 
129 aa  177  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29470  SSU ribosomal protein S11P  79.34 
 
 
135 aa  177  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.0093892  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0653  ribosomal protein S11  77.69 
 
 
135 aa  177  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
130 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  77.24 
 
 
129 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  69.83 
 
 
132 aa  176  7e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2930  30S ribosomal protein S11  80.17 
 
 
134 aa  176  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000145745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  72.8 
 
 
139 aa  176  8e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  70.43 
 
 
131 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  79.34 
 
 
135 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  69.7 
 
 
129 aa  175  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 
131 aa  176  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 
131 aa  175  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  72 
 
 
137 aa  175  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 
129 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
129 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  77.97 
 
 
130 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  72 
 
 
138 aa  174  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
130 aa  174  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  63.41 
 
 
130 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  71.97 
 
 
129 aa  174  4e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  69.57 
 
 
131 aa  174  5e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  62.9 
 
 
130 aa  173  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2627  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
133 aa  173  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  70.4 
 
 
128 aa  173  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2528  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481275  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  68.75 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  66.38 
 
 
137 aa  172  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  60.94 
 
 
130 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>