More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0291 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  62.99 
 
 		 128 aa  174  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  174  5e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  67.19 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  171  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  170  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  170  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 129 aa  170  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  169  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  59.84 
 
 		 131 aa  169  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  58.33 
 
 		 131 aa  167  4e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  64.12 
 
 		 130 aa  167  4e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  167  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  60.8 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  166  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  166  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  58.14 
 
 		 131 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  57.6 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0265  30S ribosomal protein S11  76.99 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  164  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 131 aa  164  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  64.62 
 
 		 128 aa  163  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  59.54 
 
 		 130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 		 129 aa  162  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  63.36 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  62.07 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  62.93 
 
 		 131 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  60 
 
 		 129 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  63.57 
 
 		 139 aa  160  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  62.79 
 
 		 130 aa  160  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00961  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000322377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  55.88 
 
 		 135 aa  158  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001719  SSU ribosomal protein S11p (S14e)  55.38 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000259501  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  57.69 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3613  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00134375  normal  0.497735 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0428  30S ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.316417  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0306  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000963543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3783  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0247375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00752  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3977  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.300038  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3720  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0247296  normal  0.144698 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3612  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000648166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3799  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0744309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0428  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.684596  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3685  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00109954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  60.63 
 
 		 128 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  64.46 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2151  30S ribosomal protein S11  55.38 
 
 		 129 aa  158  3e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000057735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3892  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000147745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0604  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  157  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650942  normal  0.687917 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0448  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 130 aa  157  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000201817  hitchhiker  0.00276922 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  56.15 
 
 		 129 aa  157  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>