More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1368 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1368  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000607304  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1318  30S ribosomal protein S11  100 
 
 		 130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000513052  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1112  30S ribosomal protein S11  72.31 
 
 		 130 aa  203  7e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0979  30S ribosomal protein S11  73.44 
 
 		 129 aa  199  8e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0952453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 129 aa  167  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1157  ribosomal protein S11  63.08 
 
 		 130 aa  166  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000562813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0764  ribosomal protein S11  67.29 
 
 		 129 aa  164  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0291  30S ribosomal protein S11  60.31 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000693018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1498  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 128 aa  161  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  63.96 
 
 		 131 aa  160  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1006  30S ribosomal protein S11  65.65 
 
 		 131 aa  159  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109839  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  54.33 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  53.54 
 
 		 129 aa  158  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  60.77 
 
 		 130 aa  158  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  54.76 
 
 		 127 aa  155  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  61.94 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  56.1 
 
 		 127 aa  154  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  55.74 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0241  30S ribosomal protein S11  63.85 
 
 		 129 aa  154  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  56.2 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 		 137 aa  154  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  61.26 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  55.37 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  55.37 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3620  30S ribosomal protein S11  55.37 
 
 		 134 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000402768  hitchhiker  0.00000000105746 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0424  ribosomal protein S11  60.36 
 
 		 132 aa  153  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2039  30S ribosomal protein S11  55.28 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000528036  normal  0.276902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  50.77 
 
 		 130 aa  153  9e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  51.97 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  51.18 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0205  30S ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000759645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  61.54 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0649  ribosomal protein S11  54.62 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4526  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.828676  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 130 aa  151  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5057  30S ribosomal protein S11  54.62 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000518123  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5047  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  62.99 
 
 		 137 aa  152  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4219  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 134 aa  151  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.815037  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  58.78 
 
 		 131 aa  151  2e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4481  30S ribosomal protein S11  61.98 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.401787  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3886  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  151  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0835  30S ribosomal protein S11  55.81 
 
 		 131 aa  151  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633352  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0076  30S ribosomal protein S11  49.63 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  51.54 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  51.18 
 
 		 129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0499  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2398  30S ribosomal protein S11  57.66 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000513173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0343  30S ribosomal protein S11  53.72 
 
 		 134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.255505  hitchhiker  0.000136373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1012  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 130 aa  151  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00012191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0624  30S ribosomal protein S11  56.56 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000665656  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  60.33 
 
 		 134 aa  150  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0131  30S ribosomal protein S11  56.92 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000108519  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  51.97 
 
 		 129 aa  150  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  61.6 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0477  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000237439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06480  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4726  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49415  normal  0.352381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4253  ribosomal protein S11  58.56 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000354003  unclonable  0.00000000000249554 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0860  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0510  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.0188454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2306  30S ribosomal protein S11  58.46 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00552164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  50.77 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09090  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.764994 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0790  30S ribosomal protein S11  52.07 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0644212  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0396  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0506  30S ribosomal protein S11  53.85 
 
 		 129 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00290118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0404  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 134 aa  150  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1826  30S ribosomal protein S11  56.76 
 
 		 127 aa  150  8e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  61.16 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0624  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 134 aa  150  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  59.23 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1045  30S ribosomal protein S11  52.89 
 
 		 134 aa  149  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2301  30S ribosomal protein S11  54.92 
 
 		 129 aa  149  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.598814  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  51.18 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  52.07 
 
 		 129 aa  149  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>