66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0129 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0129  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  100 
 
 		 371 aa  747    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000445979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1649  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  70.47 
 
 		 359 aa  518  1e-146  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0173  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.92 
 
 		 357 aa  484  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000696733  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0808  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  60.34 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000170863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0249  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  61.65 
 
 		 370 aa  455  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00032725  normal  0.391108 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0150  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  63.48 
 
 		 360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0115  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  56.06 
 
 		 364 aa  425  1e-118  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000323099  hitchhiker  0.00167749 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00730  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  53.91 
 
 		 362 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4364  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  41.58 
 
 		 691 aa  285  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0103685  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2483  dehydrogenase-like protein  43.17 
 
 		 728 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0417165  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2362  dehydrogenase-like protein  43.25 
 
 		 728 aa  276  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.221453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1330  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.16 
 
 		 685 aa  275  8e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.372745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1617  shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.19 
 
 		 685 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0662  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  42.58 
 
 		 681 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0104064  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1964  putative dehydrogenase  41.76 
 
 		 710 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1668  putative dehydrogenase  40.54 
 
 		 689 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0410472  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1059  dehydrogenase-like  39.84 
 
 		 684 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2305  dehydrogenase-like  42.66 
 
 		 720 aa  229  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1566  dehydrogenase-like protein  41.32 
 
 		 707 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386533  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1644  dehydrogenase-like protein  40.85 
 
 		 707 aa  223  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1254  protein of unknown function DUF205  38.08 
 
 		 574 aa  186  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9558  normal  0.305152 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0989  hypothetical protein  37.79 
 
 		 556 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.39207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1012  hypothetical protein  32.74 
 
 		 560 aa  159  8e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0262179  hitchhiker  0.000000557566 
 
 
-
 
NC_003296  RS04713  putative aminotransferase protein  32.72 
 
 		 845 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.924872 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6305  aminotransferase class-III  34.09 
 
 		 955 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.946043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5680  hypothetical protein  30.95 
 
 		 366 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0387198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0440  putative class-III aminotransferase  43.84 
 
 		 891 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0001965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2946  aminotransferase class-III  31.01 
 
 		 957 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.818635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2279  hypothetical protein  30.3 
 
 		 339 aa  127  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2534  hypothetical protein  29.32 
 
 		 339 aa  123  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.32 
 
 		 339 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.121651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0399  hypothetical protein  26.7 
 
 		 340 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.247515  normal  0.582942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0872  dehydrogenase like protein  26.21 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0898  dehydrogenase-like protein  26.21 
 
 		 340 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0157574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1594  hypothetical protein  28.53 
 
 		 341 aa  109  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.293919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05591  dehydrogenase  28.41 
 
 		 346 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0533  hypothetical protein  28.12 
 
 		 346 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2782  pyridoxalphosphate dependent aminotransferase, class III  27.13 
 
 		 959 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05891  dehydrogenase  28.12 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.735878  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2973  aminotransferase class-III  27.13 
 
 		 956 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05891  dehydrogenase  27.76 
 
 		 346 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0334693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05971  dehydrogenase  26.7 
 
 		 346 aa  96.3  7e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.620838  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1634  hypothetical protein  31.73 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.509196  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1864  dehydrogenase  27.48 
 
 		 346 aa  94.4  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05361  dehydrogenase  29.6 
 
 		 346 aa  92.8  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0729  hypothetical protein  31.7 
 
 		 346 aa  86.7  6e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07811  hypothetical protein  31.72 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3501  glutamyl-tRNA reductase  24.73 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.451054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2008  amino acid adenylation domain-containing protein  23.58 
 
 		 4101 aa  48.9  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0949  glutamyl-tRNA reductase  23.46 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2896  hypothetical protein  24.61 
 
 		 317 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0676  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0689  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0669  glutamyl-tRNA reductase  36.36 
 
 		 447 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.792193 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54134  glutamyl-trna reductase  29.36 
 
 		 512 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0214782  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4755  hypothetical protein  24.21 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0898505  normal  0.0689026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2026  glutamyl-tRNA reductase  26.76 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.244155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2005  hypothetical protein  23.77 
 
 		 408 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000375654  normal  0.0926262 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2371  Methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP(+))  28.21 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5696  glutamyl-tRNA reductase  37.27 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0137  glutamyl-tRNA reductase  24.86 
 
 		 438 aa  44.3  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0618199  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1475  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  34.65 
 
 		 285 aa  43.9  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.996402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0052  glutamyl-tRNA reductase  30.77 
 
 		 383 aa  43.5  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0279425  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3733  methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  35.14 
 
 		 284 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1746  glutamyl-tRNA reductase  27.46 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  32.92 
 
 		 428 aa  43.1  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>