296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3538 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3538  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  484  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.739224  normal  0.0386409 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1181  protein of unknown function DUF45  44.55 
 
 
242 aa  177  2e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0397  protein of unknown function DUF45  42.92 
 
 
292 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119001  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0412  protein of unknown function DUF45  42.92 
 
 
292 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.505198  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0521  hypothetical protein  43.81 
 
 
288 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0129218 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0581  hypothetical protein  42.48 
 
 
295 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0877  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  168  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0698  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0215  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.585984  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2427  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.656656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0713  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2731  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.896479  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2347  hypothetical protein  41.41 
 
 
292 aa  167  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0504  hypothetical protein  40.17 
 
 
286 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.22693  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  41.74 
 
 
218 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0443  hypothetical protein  40.79 
 
 
292 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.618297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2622  hypothetical protein  43.18 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276697  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  42.27 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  42.27 
 
 
295 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0641  hypothetical protein  39.65 
 
 
236 aa  162  6e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  40.97 
 
 
316 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  42.27 
 
 
303 aa  161  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  41.82 
 
 
295 aa  160  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0594  hypothetical protein  39.24 
 
 
301 aa  160  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0683  protein of unknown function DUF45  40.53 
 
 
300 aa  159  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.436167  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0402  hypothetical protein  40.74 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.450593  normal  0.256851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4016  hypothetical protein  39.82 
 
 
300 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00585617  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  34.93 
 
 
244 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2107  hypothetical protein  39.06 
 
 
240 aa  150  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4740  protein of unknown function DUF45  36.95 
 
 
318 aa  148  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.677282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  35.92 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3377  hypothetical protein  38.08 
 
 
320 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.577966 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1292  hypothetical protein  38.55 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.232025 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  35.04 
 
 
252 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4199  hypothetical protein  34.98 
 
 
340 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0212  hypothetical protein  37.5 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0964391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2166  hypothetical protein  37.35 
 
 
310 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4173  hypothetical protein  36.82 
 
 
303 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0547  protein of unknown function DUF45  35.83 
 
 
306 aa  135  8e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0531  hypothetical protein  35.83 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.10161 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0448  hypothetical protein  34.57 
 
 
319 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3692  hypothetical protein  33.98 
 
 
314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.349516  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0413  hypothetical protein  31.92 
 
 
249 aa  125  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  33.48 
 
 
240 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  32.58 
 
 
240 aa  123  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  32.14 
 
 
242 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  31.84 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  31.84 
 
 
246 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1763  protein of unknown function DUF45  34.3 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  30.43 
 
 
243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  29.31 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4297  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2344  hypothetical protein  37.93 
 
 
217 aa  118  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.394808 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0100  protein of unknown function DUF45  35.93 
 
 
241 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  30.69 
 
 
238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0899  hypothetical protein  35.38 
 
 
254 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145532 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  31.22 
 
 
240 aa  116  3e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0018  hypothetical protein  33.63 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  29.47 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3354  hypothetical protein  34.67 
 
 
265 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0604  protein of unknown function DUF45  33.52 
 
 
241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.068795 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1069  hypothetical protein  32.5 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.262175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0593  hypothetical protein  33.52 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0332404  normal  0.0318611 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  31.25 
 
 
224 aa  108  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  29.44 
 
 
238 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0568  protein of unknown function DUF45  33.52 
 
 
241 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.237402 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  28.99 
 
 
223 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  29.41 
 
 
227 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.81 
 
 
245 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2794  protein of unknown function DUF45  29.18 
 
 
242 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0182535  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  27.72 
 
 
237 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0503  hypothetical protein  30 
 
 
224 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  28.92 
 
 
227 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0982  zinc metallopeptidase-like protein  33.49 
 
 
228 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0036  protein of unknown function DUF45  29.58 
 
 
262 aa  102  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2642  hypothetical protein  33.49 
 
 
228 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2255  zinc metalloprotease  32.23 
 
 
227 aa  102  8e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  31 
 
 
481 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1480  hypothetical protein  33.94 
 
 
268 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  23.35 
 
 
238 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.9 
 
 
237 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  29.36 
 
 
226 aa  99.8  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0839  hypothetical protein  31.8 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  41.67 
 
 
243 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0060  protein of unknown function DUF45  30.42 
 
 
259 aa  99  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  32.88 
 
 
245 aa  99  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0668  hypothetical protein  29.82 
 
 
251 aa  98.6  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3235  hypothetical protein  31.51 
 
 
251 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0508  hypothetical protein  35.07 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  28.1 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  27.09 
 
 
254 aa  96.7  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4654  hypothetical protein  34.62 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.791009  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3493  hypothetical protein  31.43 
 
 
244 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.718444  normal  0.055231 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0807  hypothetical protein  29.95 
 
 
253 aa  95.5  6e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  29.27 
 
 
224 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03844  hypothetical protein  29.96 
 
 
263 aa  95.1  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2855  hypothetical protein  31.92 
 
 
252 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  28.63 
 
 
235 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2113  hypothetical protein  27.68 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.301869  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2029  hypothetical protein  27.68 
 
 
255 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.611915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>