More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5453 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_4122  aspartyl-tRNA synthetase  80.87 
 
 
601 aa  1014  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2038  aspartyl-tRNA synthetase  59.01 
 
 
592 aa  714  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.323108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0675  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 
600 aa  1006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0691  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.832914  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01597  aspartyl-tRNA synthetase  57.75 
 
 
592 aa  692  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2406  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2079  aspartyl-tRNA synthetase  57.29 
 
 
592 aa  689  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.725699  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3586  aspartyl-tRNA synthetase  55.29 
 
 
592 aa  640  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.9189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1892  aspartyl-tRNA synthetase  74.29 
 
 
599 aa  941  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00404218  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2434  aspartyl-tRNA synthetase  57.41 
 
 
590 aa  691  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0126074  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1935  aspartyl-tRNA synthetase  58.1 
 
 
592 aa  713  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0176325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1268  aspartyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
591 aa  736  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.132766  normal  0.965215 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0056  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
596 aa  741  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.524796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0735  aspartyl-tRNA synthetase  58.98 
 
 
591 aa  727  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  3.82007e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2196  aspartyl-tRNA synthetase  54.31 
 
 
593 aa  641  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.00775e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1242  aspartyl-tRNA synthetase  62.1 
 
 
591 aa  759  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.276348  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2040  aspartyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
592 aa  712  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00291501  hitchhiker  1.15872e-07 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0991  aspartyl-tRNA synthetase  59.36 
 
 
601 aa  731  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  1.25703e-08  unclonable  1.15783e-09 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2326  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1070  aspartyl-tRNA synthetase  79.43 
 
 
599 aa  1017  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.17773 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0010  aspartyl-tRNA synthetase  54.56 
 
 
627 aa  643  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000218304  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36730  aspartyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
591 aa  744  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2725  aspartyl-tRNA synthetase  79.33 
 
 
600 aa  1001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0872752  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1953  aspartyl-tRNA synthetase  59.32 
 
 
591 aa  717  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154117  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0593  aspartyl-tRNA synthetase  54.39 
 
 
594 aa  635  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00934088  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1843  aspartyl-tRNA synthetase  58.5 
 
 
591 aa  701  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.986528  normal  0.35056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0803  aspartyl-tRNA synthetase  89.05 
 
 
603 aa  1122  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.979885  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0699  aspartyl-tRNA synthetase  57.58 
 
 
592 aa  694  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2240  aspartyl-tRNA synthetase  61.91 
 
 
592 aa  761  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1707  aspartyl-tRNA synthetase  60.6 
 
 
599 aa  749  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  4.68378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0028  aspartyl-tRNA synthetase  54.04 
 
 
610 aa  637  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.607813  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3637  aspartyl-tRNA synthetase  90.52 
 
 
604 aa  1139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0787  aspartyl-tRNA synthetase  82.46 
 
 
605 aa  1043  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574625  normal  0.685476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0874  aspartyl-tRNA synthetase  89.05 
 
 
603 aa  1122  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.104539  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2752  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1326  aspartyl-tRNA synthetase  81.7 
 
 
604 aa  1040  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2226  aspartyl-tRNA synthetase  60.1 
 
 
617 aa  734  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.544329  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12140  Aspartyl-tRNA synthetase  52.96 
 
 
590 aa  637  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.46901e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1170  aspartyl-tRNA synthetase  71.84 
 
 
599 aa  895  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2187  aspartyl-tRNA synthetase  60.47 
 
 
590 aa  749  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  1.46204e-05  normal  0.319945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4545  aspartyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 
590 aa  742  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.486893  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2060  aspartyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
590 aa  692  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0198036 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0574  aspartyl-tRNA synthetase  79.66 
 
 
600 aa  1006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0673836  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1751  aspartyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
590 aa  681  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  1.2582e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4205  aspartyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
591 aa  756  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.103347  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2148  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
598 aa  698  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1766  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
590 aa  698  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.836624  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1320  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
590 aa  698  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4002  aspartyl-tRNA synthetase  61.59 
 
 
591 aa  751  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2575  aspartyl-tRNA synthetase  56.95 
 
 
595 aa  685  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.63507e-05  hitchhiker  0.000702641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2752  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
600 aa  1003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.314882  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4013  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
598 aa  1004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.44023e-06 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1597  aspartyl-tRNA synthetase  74.12 
 
 
600 aa  943  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.566711 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2643  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
600 aa  1003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.21858  normal  0.167975 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1622  aspartyl-tRNA synthetase  53.17 
 
 
598 aa  635  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  2.05655e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0381  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 
599 aa  1003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26589  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1106  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
590 aa  698  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0656  aspartyl-tRNA synthetase  78.32 
 
 
599 aa  989  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5453  aspartyl-tRNA synthetase  100 
 
 
600 aa  1244  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2423  aspartyl-tRNA synthetase  58.67 
 
 
592 aa  710  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  6.67018e-05  normal  0.106149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2115  aspartyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
590 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789525 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2602  aspartyl-tRNA synthetase  57.72 
 
 
590 aa  697  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.445839  normal  0.911145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2307  aspartyl-tRNA synthetase  58.84 
 
 
592 aa  712  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.41226e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1886  aspartyl-tRNA synthetase  56.01 
 
 
591 aa  686  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2426  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
598 aa  697  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0626295  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2035  aspartyl-tRNA synthetase  57.02 
 
 
598 aa  697  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.1996  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0057  aspartyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
596 aa  741  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  2.41419e-07  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1346  aspartyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
590 aa  691  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0494228  hitchhiker  0.00190768 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0423  aspartyl-tRNA synthetase  55.41 
 
 
610 aa  679  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  9.68757e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1222  aspartyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
590 aa  692  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.241157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2903  aspartyl-tRNA synthetase  54.81 
 
 
593 aa  637  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.05553e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1959  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
590 aa  698  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9398  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2096  aspartyl-tRNA synthetase  57.89 
 
 
590 aa  698  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.356263  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2030  aspartyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 
595 aa  682  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.019591  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2781  aspartyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 
593 aa  699  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.332179  normal  0.0858323 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2366  aspartyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 
597 aa  689  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00207934  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01727  aspartyl-tRNA synthetase  60.14 
 
 
586 aa  718  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2055  aspartyl-tRNA synthetase  56.88 
 
 
590 aa  692  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0341  aspartyl-tRNA synthetase  79.26 
 
 
623 aa  1004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4411  aspartyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
591 aa  754  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00200172  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1550  aspartyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 
593 aa  688  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0560  aspartyl-tRNA synthetase  80 
 
 
600 aa  1009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1297  aspartyl-tRNA synthetase  80.66 
 
 
611 aa  1030  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.474496  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1434  aspartyl-tRNA synthetase  54.82 
 
 
593 aa  691  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0913  aspartyl-tRNA synthetase  60.17 
 
 
594 aa  726  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  8.46052e-09  decreased coverage  2.30652e-07 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0193  aspartyl-tRNA synthetase  79.83 
 
 
600 aa  1004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.624275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2384  aspartyl-tRNA synthetase  69.06 
 
 
594 aa  872  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  3.93733e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0866  aspartyl-tRNA synthetase  83.98 
 
 
601 aa  1060  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.770528  normal  0.0740151 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1776  aspartyl-tRNA synthetase  59.5 
 
 
599 aa  723  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4043  aspartyl-tRNA synthetase  78.49 
 
 
599 aa  994  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0426746  normal  0.173389 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1887  aspartyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 
593 aa  707  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00122802  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1844  aspartyl-tRNA synthetase  60.98 
 
 
592 aa  723  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00295429  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1183  aspartyl-tRNA synthetase  58.14 
 
 
608 aa  717  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  9.58333e-05  hitchhiker  0.00287943 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0603  aspartyl-tRNA synthetase  66.72 
 
 
588 aa  825  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1406  aspartyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 
591 aa  744  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  2.71682e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1040  aspartyl-tRNA synthetase  55.89 
 
 
596 aa  645  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.0223e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6052  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
600 aa  1003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2099  aspartyl-tRNA synthetase  57.24 
 
 
598 aa  709  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2776  aspartyl-tRNA synthetase  79.5 
 
 
600 aa  1002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.233707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1357  aspartyl-tRNA synthetase  54.48 
 
 
594 aa  643  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.12068e-12  unclonable  2.29944e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>