More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5354 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  100 
 
 		 309 aa  605  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  91.91 
 
 		 309 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  90.29 
 
 		 309 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  90.29 
 
 		 309 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  86.41 
 
 		 338 aa  531  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  83.82 
 
 		 309 aa  511  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  82.2 
 
 		 309 aa  509  1e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  82.85 
 
 		 309 aa  502  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  81.55 
 
 		 309 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  82.85 
 
 		 309 aa  492  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  77.99 
 
 		 335 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0759  inner-membrane translocator  73.72 
 
 		 311 aa  430  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000754526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  65.59 
 
 		 311 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  66.56 
 
 		 311 aa  394  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  64.56 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  65.27 
 
 		 311 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2708  inner-membrane translocator  65.27 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2318  inner-membrane translocator  65.27 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.249302  hitchhiker  0.00247249 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  65.19 
 
 		 317 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  63.92 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  62.03 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  62.66 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  62.34 
 
 		 316 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  62.03 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  62.34 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  62.03 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  62.34 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  62.03 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  62.34 
 
 		 316 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  62.03 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.71 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  61.71 
 
 		 316 aa  375  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  61.39 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  62.97 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  63.61 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  58.39 
 
 		 319 aa  348  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2472  inner-membrane translocator  61.29 
 
 		 310 aa  348  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1729  inner-membrane translocator  62.38 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2549  inner-membrane translocator  60.76 
 
 		 316 aa  307  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  47.12 
 
 		 302 aa  262  6e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4918  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein BraD  49.35 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0598  inner-membrane translocator  49.03 
 
 		 304 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34105  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  46.15 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2396  inner-membrane translocator  47.49 
 
 		 302 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.228148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2397  inner-membrane translocator  47.08 
 
 		 300 aa  258  8e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00620383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2501  inner-membrane translocator  45.31 
 
 		 302 aa  256  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1112  inner-membrane translocator  48.22 
 
 		 302 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3515  ABC transporter membrane spanning protein  45.78 
 
 		 300 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1725  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.9 
 
 		 302 aa  254  9e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1791  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  47.9 
 
 		 302 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3328  inner-membrane translocator  45.13 
 
 		 300 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166964  normal  0.584188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4922  inner-membrane translocator  48.05 
 
 		 304 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.75867  hitchhiker  0.0000000000177319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4866  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.445859  hitchhiker  0.000815383 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4744  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579328  hitchhiker  0.000000155208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0553  inner-membrane translocator  46.96 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0455233  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4658  inner-membrane translocator  47.73 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026431 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  45.51 
 
 		 303 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  43.83 
 
 		 300 aa  249  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64890  putative permease of ABC branched chain amino acid transporter  47.08 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3202  inner-membrane translocator  46.93 
 
 		 338 aa  241  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.412227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2239  inner-membrane translocator  46.6 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3323  inner-membrane translocator  44.16 
 
 		 309 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  44.34 
 
 		 304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.95 
 
 		 308 aa  237  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2429  inner-membrane translocator  41.21 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.614779  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  44.95 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2209  branched chain amino acid ABC transporter permease  43.67 
 
 		 304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.396823  normal  0.65944 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2493  inner-membrane translocator  45.25 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.440826  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3900  inner-membrane translocator  45.19 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.37018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.63 
 
 		 308 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2555  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  44.12 
 
 		 293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.1036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1721  inner-membrane translocator  43.56 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.021923  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0105  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.31 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0229  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.49 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.689889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1622  inner-membrane translocator  43.45 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.937087 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2934  inner-membrane translocator  43.73 
 
 		 297 aa  232  5e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.84432  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  42.31 
 
 		 308 aa  232  6e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1130  inner-membrane translocator  45.28 
 
 		 293 aa  231  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3535  inner-membrane translocator  44.12 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.152281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5323  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter (permease protein)  43.31 
 
 		 305 aa  230  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.446123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0611  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  45.07 
 
 		 302 aa  230  3e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  42.95 
 
 		 308 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1387  inner-membrane translocator  44.52 
 
 		 294 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0359  inner-membrane translocator  44.01 
 
 		 300 aa  228  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  42.63 
 
 		 301 aa  227  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  40.57 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  43.59 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1391  inner-membrane translocator  44.19 
 
 		 294 aa  227  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  43.09 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2611  inner-membrane translocator  43.04 
 
 		 304 aa  226  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.404951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1066  inner-membrane translocator  42.44 
 
 		 297 aa  226  4e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00641991  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3667  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  41.16 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.344938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3973  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  41.16 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.883814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0245  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  41.16 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5637  branched chain amino acid ABC transporter permease  46.75 
 
 		 304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4925  inner-membrane translocator  43.32 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0402653  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26120  ABC-transporter permease protein  46.1 
 
 		 304 aa  226  6e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000346731  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 308 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  42.12 
 
 		 308 aa  225  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>