More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4019 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1710  ABC transporter  77.68 
 
 		 605 aa  933    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732673  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2240  ABC transporter  77.13 
 
 		 626 aa  926    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2971  ABC transporter  57.21 
 
 		 597 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3498  ABC transporter  75.96 
 
 		 615 aa  911    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.661743 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4019  ABC transporter  100 
 
 		 606 aa  1225    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0431407  normal  0.349748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1864  ABC transporter  76.63 
 
 		 602 aa  919    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1469  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.66 
 
 		 598 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2885  ABC transporter  44.69 
 
 		 636 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.306309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2854  ABC transporter-like protein  44.69 
 
 		 634 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2898  ABC transporter  44.69 
 
 		 636 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.273614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11849  drug ABC transporter ATP-binding protein  45.09 
 
 		 639 aa  531  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3410  ABC transporter  43.23 
 
 		 635 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3409  ABC transporter  45 
 
 		 633 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.547153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3164  ABC transporter  43.46 
 
 		 637 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0211349  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3163  ABC transporter  44.91 
 
 		 632 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705565  normal  0.189612 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2884  ABC transporter  43.67 
 
 		 626 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2853  ABC transporter related  40.76 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453097  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2897  ABC transporter  40.76 
 
 		 670 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0152  ABC transporter domain protein  39.3 
 
 		 590 aa  429  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199241  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0552  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.72 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0707  ABC transporter domain protein  39.72 
 
 		 587 aa  422  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000255653 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1326  ABC transporter domain protein  39.19 
 
 		 586 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0735  ABC transporter-like  40.51 
 
 		 613 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4731  ABC transporter-like  41.11 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.612585  normal  0.660257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0638  ABC transporter  40.17 
 
 		 610 aa  417  9.999999999999999e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.226962  normal  0.140923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0667  ABC transporter domain protein  42.09 
 
 		 596 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4132  ABC transporter-like  40.29 
 
 		 630 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.588155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0737  ABC transporter-like  40 
 
 		 614 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1832  ABC transporter-like  39.68 
 
 		 583 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0566621 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1179  ABC transporter domain protein  42.4 
 
 		 595 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1667  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  38.92 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4948  ABC transporter domain protein  40.76 
 
 		 704 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.44049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0822  ABC transporter-like  39.16 
 
 		 575 aa  405  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3430  ABC transporter  41.12 
 
 		 708 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18221 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1064  ABC transporter domain protein  39.58 
 
 		 593 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4485  ABC transporter  40.14 
 
 		 712 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.991125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1852  ABC transporter  41.12 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0298007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5001  ABC transporter domain protein  39.5 
 
 		 704 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.650966 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4654  ABC transporter domain protein  40.87 
 
 		 713 aa  399  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.435698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0429  ABC transporter related  39.21 
 
 		 621 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0620153  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0559  ABC transporter  39.12 
 
 		 588 aa  391  1e-107  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.393268  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2461  ABC transporter  39.05 
 
 		 606 aa  388  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.142821  normal  0.345293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3843  ABC transporter  39.71 
 
 		 578 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2775  ABC transporter  36.74 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4551  ABC transporter, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.859512  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0331  ABC transporter domain protein  39.89 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.441162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1740  ABC transporter  37.41 
 
 		 712 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000825117 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0346  ABC transporter domain protein  39.89 
 
 		 614 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.274021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0799  ABC transporter related  35.33 
 
 		 701 aa  372  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0267156 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3576  ABC transporter domain protein  36.83 
 
 		 583 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0754799  hitchhiker  0.00000117282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0382  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.49 
 
 		 592 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1219  ABC transporter  36.27 
 
 		 595 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3507  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.26 
 
 		 589 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2698  ABC transporter-like  36.25 
 
 		 589 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0409  ABC transporter  36.25 
 
 		 589 aa  360  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0847307  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0388  ABC transporter  36.06 
 
 		 589 aa  360  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0456  ATP-binding transport ABC transporter protein  38.82 
 
 		 614 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.709933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4229  ABC transporter:ABC transporter, N-terminal  40.04 
 
 		 572 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0369  ABC transporter-like protein  36.53 
 
 		 636 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.455646  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0336  ABC transporter  35.42 
 
 		 589 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.294433  normal  0.265185 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0327  ABC transporter  35.6 
 
 		 589 aa  356  8.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0312  ABC transporter  36.4 
 
 		 589 aa  349  9e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3009  ABC transporter, ATP-binding protein  38.03 
 
 		 588 aa  347  3e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2731  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3711  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3221  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.85 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1771  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 588 aa  347  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.425769  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2783  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.85 
 
 		 584 aa  346  6e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3684  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.66 
 
 		 588 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3741  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.66 
 
 		 588 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.699706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1048  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.05 
 
 		 599 aa  341  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2634  ABC transporter domain protein  33.7 
 
 		 563 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00761  ABC transporter, ATP binding protein  36.79 
 
 		 660 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0067  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 		 660 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00771  ABC transporter, ATP binding protein  37.05 
 
 		 660 aa  333  8e-90  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.209833  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00741  ABC transporter, ATP binding protein  36.4 
 
 		 660 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03151  ABC transporter, ATP binding protein  35.56 
 
 		 667 aa  326  9e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0622  ATPase  36.58 
 
 		 665 aa  317  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.333082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1577  ABC transporter domain protein  36.23 
 
 		 667 aa  317  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.482114  hitchhiker  0.0000264384 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0331  ABC transporter related  34.11 
 
 		 534 aa  306  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0414  ATPase  34.36 
 
 		 668 aa  305  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1330  ABC transporter domain protein  34.01 
 
 		 663 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1359  ABC transporter domain protein  34.01 
 
 		 663 aa  303  5.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164606 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2266  ATPase  34.45 
 
 		 658 aa  301  2e-80  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6112  ABC transporter  35.65 
 
 		 603 aa  301  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3678  ABC transporter  36.57 
 
 		 575 aa  300  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3826  ABC transporter related  36.65 
 
 		 576 aa  297  4e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1803  ABC transporter  36.32 
 
 		 576 aa  296  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.550427 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4887  ABC transporter domain protein  32.16 
 
 		 589 aa  296  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0424  ABC transporter  35.18 
 
 		 640 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1645  ABC transporter related  36.01 
 
 		 570 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0233  putative ABC transporter (fused ATP-binding and permease components)  31.35 
 
 		 651 aa  287  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.525703  normal  0.627984 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1428  ABC transporter ATP-binding protein  31.73 
 
 		 662 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5296  ABC transporter domain protein  34.36 
 
 		 567 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01291  ABC transporter, ATP binding protein  31.55 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.103096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0045  ABC transporter related  34.64 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00731  ABC transporter, ATP binding protein  31.65 
 
 		 662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.862442 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1153  ABC transporter domain protein  33.7 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3439  ABC transporter related  35.14 
 
 		 588 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0157  ABC transporter related  31.71 
 
 		 674 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0036118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>