68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2909 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 163 aa  340  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  61.11 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  61.11 
 
 		 160 aa  208  3e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  59.86 
 
 		 164 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  55.76 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  64.29 
 
 		 181 aa  192  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  58.75 
 
 		 171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  55.06 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  56.52 
 
 		 164 aa  183  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  52.23 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  49.38 
 
 		 163 aa  155  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  56.3 
 
 		 166 aa  149  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  56.3 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  56.3 
 
 		 168 aa  147  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  49.31 
 
 		 272 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  50.42 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  45.7 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  45.7 
 
 		 162 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  44.08 
 
 		 170 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  43.64 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  44.71 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  41.46 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 160 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  43.75 
 
 		 159 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  38.12 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  43.09 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  41.04 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  41.73 
 
 		 156 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  40.8 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  41.09 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  36.53 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  42.86 
 
 		 153 aa  107  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  42.86 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  39.01 
 
 		 177 aa  101  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  40.31 
 
 		 176 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  37.7 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  38.26 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  39.34 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  38.67 
 
 		 182 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  37.58 
 
 		 205 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  35.86 
 
 		 177 aa  89  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  34.23 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.64 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.45 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  31.68 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  27.16 
 
 		 169 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  32.62 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  30.97 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  28.81 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  28.15 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  27.74 
 
 		 534 aa  58.9  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  27.73 
 
 		 287 aa  53.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  25.42 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  28.8 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  32.2 
 
 		 178 aa  51.2  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  26.79 
 
 		 140 aa  48.1  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 125 aa  47  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  28.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  22.31 
 
 		 722 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  23.62 
 
 		 669 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  25.49 
 
 		 505 aa  41.2  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  24.59 
 
 		 314 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  23.2 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2909  azurin  27.82 
 
 		 165 aa  40.8  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2975  copper tolerance protein  44.19 
 
 		 143 aa  40.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>