145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1613 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1613  hypothetical protein  100 
 
 		 339 aa  694    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2623  hypothetical protein  36.49 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2032  hypothetical protein  33.46 
 
 		 280 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000839073  normal  0.0310956 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7311  hypothetical protein  32.35 
 
 		 319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.408768  hitchhiker  0.000851428 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4317  hypothetical protein  28.71 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450862 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3662  hypothetical protein  34.83 
 
 		 324 aa  80.9  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.508522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  32.52 
 
 		 326 aa  63.9  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1632  parB-like partition protein  29.02 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.526467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1885  hypothetical protein  27.23 
 
 		 532 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000551377  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0043  hypothetical protein  30.1 
 
 		 326 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  34.48 
 
 		 306 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2275  parB-like partition proteins  28.87 
 
 		 605 aa  59.7  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.174874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  31.28 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  33.11 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  32.21 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0093  DNA-binding protein  24.75 
 
 		 385 aa  57  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1225  chromosome segregation DNA-binding protein  30.37 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  30.37 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5405  parB-like partition protein  29.27 
 
 		 477 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  33.33 
 
 		 317 aa  55.5  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  32.03 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  32.56 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  31.33 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4586  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 329 aa  53.5  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0288835  hitchhiker  0.000542955 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  31.33 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3193  parB-like partition protein  29.89 
 
 		 274 aa  53.1  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  30.81 
 
 		 323 aa  52.8  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0096  parB-like partition proteins  34.03 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3278  chromosome segregation DNA-binding protein  34.03 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.325017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2959  parB-like partition proteins  34.03 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0050  putative ParB partition protein  26.62 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0113  parB-like partition protein  34.03 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3317  stage 0 sporulation protein J, putative  33.33 
 
 		 295 aa  50.8  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0203  chromosome segregation DNA-binding protein  30.38 
 
 		 301 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.435492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5104  parB-like partition protein  32.45 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000234759 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1158  hypothetical protein  28.09 
 
 		 456 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2947  stage 0 sporulation protein J, putative  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0187  chromosome partitioning protein ParB  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323647  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3364  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3780  chromosome segregation DNA-binding protein  30.82 
 
 		 303 aa  50.1  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000296744 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1596  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.265363  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3979  ParB family protein  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0625323  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4053  ParB family protein  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3006  putative stage 0 sporulation protein J  33.33 
 
 		 295 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2849  chromosome segregation DNA-binding protein  36.96 
 
 		 298 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573322  normal  0.191816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  32.67 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  29.33 
 
 		 299 aa  49.7  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.26 
 
 		 595 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6342  parB-like partition protein  28.21 
 
 		 378 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.291043 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  30.87 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0031  chromosome segregation DNA-binding protein  33.56 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  29.33 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2154  chromosome segregation DNA-binding protein  30.82 
 
 		 321 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  36.62 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  31.06 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3750  chromosome segregation DNA-binding protein  33.8 
 
 		 305 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000652126  unclonable  0.00000102935 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2591  parB-like partition protein  30 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.107076 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3902  parB-like partition protein  33.56 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  35.87 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3036  parB-like partition protein  32.41 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0388  parB-like partition proteins  38.03 
 
 		 296 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.450209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  34.33 
 
 		 256 aa  47.8  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0053  parB-like partition proteins  32.89 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0207  parB-like partition protein  30.05 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  25.11 
 
 		 280 aa  47.4  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2960  chromosome segregation DNA-binding protein  33.11 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4138  chromosome segregation DNA-binding protein  26.98 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.001205  hitchhiker  0.000138083 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0007  parB-like partition proteins  28.19 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2663  parB-like partition protein  28.27 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0851711  normal  0.479198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4385  chromosome partitioning protein  29.14 
 
 		 292 aa  47  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6480  parB-like partition protein  29.53 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  34.64 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  29.28 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  31.54 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4025  chromosome segregation DNA-binding protein  26.98 
 
 		 292 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.006539  normal  0.910655 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  34.64 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3097  ParB family protein  30.14 
 
 		 668 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0650807  decreased coverage  0.0000165149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9383  ParB-like partition protein  28.86 
 
 		 324 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3933  chromosome segregation DNA-binding protein  26.98 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000290836  hitchhiker  0.00288573 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2569  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 284 aa  46.2  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  28.08 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4861  parB-like partition protein  28.1 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.601525  normal  0.0966041 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  32.17 
 
 		 669 aa  46.6  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3201  parB-like partition protein  36.62 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0006  ParB family chromosome partioning protein  27.13 
 
 		 279 aa  45.4  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.269835  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  26.17 
 
 		 283 aa  45.8  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  31.97 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0031  chromosome segregation DNA-binding protein  39.39 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0740536 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0018  parB-like partition protein  30.07 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0417799  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  28.23 
 
 		 596 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  28.94 
 
 		 293 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0038  spoOJ protein  27.4 
 
 		 280 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  29.79 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  27.78 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0056  chromosome segregation DNA-binding protein  40.91 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5303  parB-like partition protein  30.87 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157969  normal  0.0415765 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0419  parB-like partition protein  25.15 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.220541  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2788  parB-like partition protein  26.67 
 
 		 279 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4019  parB-like partition protein  28.47 
 
 		 283 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0051  parB-like partition protein  39.39 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>