12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2623 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2623  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  710    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2032  hypothetical protein  54.74 
 
 
280 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000839073  normal  0.0310956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1613  hypothetical protein  37.78 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0414314  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7311  hypothetical protein  33.83 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.408768  hitchhiker  0.000851428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3662  hypothetical protein  33.96 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.508522  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4317  hypothetical protein  27.71 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.450862 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0093  DNA-binding protein  23.39 
 
 
385 aa  51.2  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569679  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4494  ParB family protein  28.57 
 
 
294 aa  49.3  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00131449  hitchhiker  0.00000708734 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  27.74 
 
 
293 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4906  parB-like partition protein  27.11 
 
 
296 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00066278  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4590  parB-like partition protein  30.66 
 
 
306 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.740178  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4248  parB-like partition protein  25.13 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00203372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>