23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2032 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2032  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000839073  normal  0.0310956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2623  hypothetical protein  54.74 
 
 		 344 aa  266  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1613  hypothetical protein  32.21 
 
 		 339 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7311  hypothetical protein  33.01 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.408768  hitchhiker  0.000851428 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3662  hypothetical protein  37.34 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.508522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4317  hypothetical protein  29.95 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450862 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  30.81 
 
 		 293 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4953  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 283 aa  48.9  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000194343  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  28.4 
 
 		 293 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4995  hypothetical protein  24.62 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.263576 
 
 
-
 
NC_002620  TC0060  ParB family chromosome partioning protein  25.13 
 
 		 280 aa  46.2  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.00610373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1885  hypothetical protein  26.02 
 
 		 532 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000551377  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6062  plasmid partitioning protein ParB  25.83 
 
 		 369 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.145441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5044  parB family protein  27.82 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4361  parB-like partition protein  26.81 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  28.99 
 
 		 286 aa  44.3  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3552  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  30.23 
 
 		 293 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4009  chromosome segregation DNA-binding protein  30.43 
 
 		 304 aa  42.7  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0625805 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0293  parB-like partition protein  28.57 
 
 		 296 aa  42.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145749  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1396  parB-like partition protein  32.23 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0186141  hitchhiker  0.0000927483 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0189  chromosome partitioning protein ParB  28.46 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.807287  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2086  parB-like partition protein  29.1 
 
 		 292 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>