11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7311 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7311  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.408768  hitchhiker  0.000851428 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1613  hypothetical protein  32.35 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0414314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0093  DNA-binding protein  29.38 
 
 		 385 aa  95.9  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.569679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2623  hypothetical protein  33.83 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.920357  normal  0.0810814 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2032  hypothetical protein  32.68 
 
 		 280 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000839073  normal  0.0310956 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4995  hypothetical protein  29.55 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.263576 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4317  hypothetical protein  25.27 
 
 		 342 aa  50.4  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.450862 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9165  plasmid partitioning protein  30 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4976  plasmid partitioning protein  31.03 
 
 		 559 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4750  plasmid partitioning protein  30 
 
 		 597 aa  43.1  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4317  plasmid partitioning protein  27.4 
 
 		 579 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>