More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4254 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4254  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  557  1e-158  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0441349  normal  0.902161 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1221  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.33 
 
 
246 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
265 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000457845  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.03 
 
 
259 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.805205  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.65 
 
 
260 aa  194  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0797  ABC transporter, permease protein, putative  42.98 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0643  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
251 aa  180  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0881  putative ABC transporter, permease protein  42.56 
 
 
251 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00328051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4547  putative ABC transporter, permease protein  42.56 
 
 
251 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.113137  normal  0.441246 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0877  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
260 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0637  ABC transporter, permease  42.15 
 
 
250 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3645  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0784  putative ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 
250 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.605831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0693  ABC transporter permease  41.74 
 
 
250 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0637  ABC transporter, permease  41.74 
 
 
250 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0727  ABC transporter permease  41.74 
 
 
250 aa  178  7e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0804  putative ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
250 aa  178  9e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.22036e-46 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
278 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1862  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
257 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116723  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
250 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3118  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.98 
 
 
284 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.18 
 
 
254 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.63161  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13670  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, permease component  37.04 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.91 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
255 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
288 aa  170  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.173855  normal  0.365472 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0493  putative ABC transporter, permease protein  35.39 
 
 
257 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
257 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
274 aa  169  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0446  putative ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
257 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0424  putative ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
257 aa  169  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0491  ABC transporter, permease protein, putative  34.98 
 
 
257 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0367  ABC transporter permease  34.98 
 
 
265 aa  168  7e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0357  ABC transporter, permease  34.98 
 
 
265 aa  168  7e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0354  ABC transporter, permease  34.98 
 
 
265 aa  169  7e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0381  ABC transporter permease  34.98 
 
 
257 aa  169  7e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4878  putative ABC transporter, permease protein  34.98 
 
 
255 aa  168  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
268 aa  167  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.223421 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0370  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
258 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0211  ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 
258 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0202  ABC transporter, permease protein  42.42 
 
 
258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.333865  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000865  hydroxymethylpyrimidine ABC transporter transmembrane component  36.47 
 
 
266 aa  163  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0666  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
272 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2064  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
254 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3961  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
272 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3758  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
256 aa  162  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
281 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
258 aa  161  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42897 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06840  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system permease component  35.29 
 
 
266 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2985  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
273 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
272 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.025765  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0801  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter inner membrane protein  35.62 
 
 
298 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0745387  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
249 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.04587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.52 
 
 
261 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283078  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
255 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1091  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.74 
 
 
258 aa  154  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0347556  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
257 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0033  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
243 aa  153  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0488  putative binding protein-dependent transport system, membrane component  37.18 
 
 
272 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.970837  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5406  ABC transporter membrane spanning protein  35.98 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.408693  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2376  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  34.02 
 
 
265 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0620  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
258 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0770  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.27 
 
 
273 aa  150  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
255 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0394  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
259 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00657833 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0435  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
250 aa  149  5e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3181  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0283642  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.39 
 
 
245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0476  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.62 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1445  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.318112 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 
238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.98825  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
247 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2297  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.92 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0792355  normal  0.132671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1140  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.92 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.77 
 
 
254 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.302994  normal  0.157809 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
284 aa  145  9e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.65192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1676  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.53 
 
 
287 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00381914  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0906  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.65 
 
 
244 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.53091  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0644  ABC transporter, inner membrane subunit  42.45 
 
 
238 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7650  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, inner membrane subunit  35.87 
 
 
247 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.621765  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
271 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
283 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3552  ABC transporter membrane spanning protein  34.55 
 
 
285 aa  142  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0625026  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7629  putative ABC transporter permease protein  34.03 
 
 
282 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.262472  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
222 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4268  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0113678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1169  putative ABC transporter permease protein  33.2 
 
 
279 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0814  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
270 aa  140  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.946292  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.32 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2038  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.743835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>